20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0478 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0478  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 		 145 aa  289  7e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.49685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  69.44 
 
 		 145 aa  201  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.304231 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1350  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  65.07 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0323  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  63.83 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.108056  normal  0.0606842 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.26 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1865  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.33 
 
 		 254 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.58 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  36.62 
 
 		 997 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.76 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.76 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0593  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.33 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.86 
 
 		 249 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.86 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.98 
 
 		 237 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.7 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1217  hypothetical protein  24.82 
 
 		 289 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 		 254 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>