74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1085 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1085  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 		 172 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1904  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  53.25 
 
 		 184 aa  154  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.654377  hitchhiker  0.000324365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5950  hypothetical protein  52.94 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0274787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1195  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  48.15 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5116  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  52.07 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1887  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  56.83 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0866287  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1612  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  51.53 
 
 		 225 aa  139  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5141  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  45.62 
 
 		 170 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1087  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  51.27 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5653  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  49.69 
 
 		 167 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0227  hypothetical protein  51.57 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1950  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  54.72 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1869  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  51.61 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1060  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  49.69 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1076  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  49.69 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0203  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase domain-containing protein  45.96 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1159  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  51.52 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.772846  hitchhiker  0.00322732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11162  hypothetical protein  47.5 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2103  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  48.1 
 
 		 169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0397  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  48.12 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.16097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0429  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  48.12 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2391  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  44.65 
 
 		 207 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2376  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.95 
 
 		 184 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2329  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.95 
 
 		 184 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2368  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  43.95 
 
 		 184 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4104  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  46.3 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346459  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00510  hypothetical protein  48.12 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20725  normal  0.798456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2732  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  36.2 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2611  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.11 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_002950  PG1868  hypothetical protein  29.3 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0211  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0205  hypothetical protein  27.27 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0267  hypothetical protein  26.86 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2408  hypothetical protein  23.72 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  34.94 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.94 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1881  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.96 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3527  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.63 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.528255  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0193  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.87 
 
 		 229 aa  50.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00375189  decreased coverage  0.000266905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3520  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.76 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492872  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.9 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.9 
 
 		 219 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4508  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.3 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.142776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1797  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.06 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2780  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0802217  hitchhiker  0.0000249152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.29 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5096  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.32 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.887346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1692  hypothetical protein  33.68 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0557  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.32 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3272  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.32 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0012  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.58 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1062  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  32.47 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.600459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1856  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.94 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5033  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.83 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.46797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0275  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.68 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.6638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0501  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.11 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1004  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.14 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00191791  normal  0.0260384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2179  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  34.94 
 
 		 219 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0864264 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13450  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.38 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0208  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.33 
 
 		 219 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1182  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.96 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.21 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4825  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.9 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5444  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.9 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6308  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5417  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  33.9 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.481614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1821  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.21 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153367  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1271  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.73 
 
 		 195 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1746  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  37.21 
 
 		 194 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0781  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  31.25 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.225749  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2737  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.14 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1564  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  27.27 
 
 		 224 aa  40.8  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0186  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  35.14 
 
 		 218 aa  40.8  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>