30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2611 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2611  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  100 
 
 		 176 aa  353  8.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_002950  PG1868  hypothetical protein  47.65 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2408  hypothetical protein  43.9 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0211  hypothetical protein  43.71 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0205  hypothetical protein  43.71 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0267  hypothetical protein  37.97 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1904  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  29.81 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.654377  hitchhiker  0.000324365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1195  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.83 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1612  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.16 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2391  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  28.99 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1085  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.33 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1887  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.28 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0866287  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5141  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.42 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.60085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5950  hypothetical protein  26.71 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0274787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1087  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.06 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1076  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.31 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1060  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  23.31 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11162  hypothetical protein  22.78 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0203  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase domain-containing protein  27.43 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1871  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.3 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0919541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2216  hypothetical protein  30.3 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.660461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1950  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  25.17 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4789  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  27.78 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2368  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.38 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2329  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.38 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2376  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  24.38 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5331  isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26.98 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5116  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  22.54 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0763  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  26 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2022  hypothetical protein  24.77 
 
 		 219 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166485  normal  0.296374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>