56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3843 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3114  hypothetical protein  97.77 
 
 		 359 aa  721    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3843  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  737    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3661  hypothetical protein  76.22 
 
 		 332 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.238992  normal  0.308547 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5998  hypothetical protein  44.67 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2853  hypothetical protein  44.16 
 
 		 352 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2625  hypothetical protein  43.66 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2597  hypothetical protein  42.33 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2820  hypothetical protein  42.33 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10809  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4904  hypothetical protein  41.48 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.149118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2714  hypothetical protein  42 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5369  hypothetical protein  42.23 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5074  hypothetical protein  40.6 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1802  hypothetical protein  41.76 
 
 		 388 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3607  hypothetical protein  42.11 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176723  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3629  hypothetical protein  43.36 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3913  hypothetical protein  39.71 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2247  hypothetical protein  40.28 
 
 		 363 aa  255  8e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3414  hypothetical protein  40.44 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  0.908388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3723  hypothetical protein  40.44 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  0.0498244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1820  hypothetical protein  41.58 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0779908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0615  hypothetical protein  41.53 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0724  hypothetical protein  41.71 
 
 		 467 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0438  hypothetical protein  40.31 
 
 		 457 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3655  hypothetical protein  41.03 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4405  hypothetical protein  40.32 
 
 		 409 aa  249  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0657  hypothetical protein  41.53 
 
 		 361 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2030  protein of unknown function UCP012641  38.66 
 
 		 387 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3868  hypothetical protein  43.13 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2071  protein of unknown function UCP012641  40.46 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3036  hypothetical protein  40.11 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.898548  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2838  hypothetical protein  39.08 
 
 		 366 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1620  hypothetical protein  39.11 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3515  hypothetical protein  39.13 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1804  hypothetical protein  40.43 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0773  hypothetical protein  38.92 
 
 		 352 aa  238  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02369  hypothetical protein  40.56 
 
 		 355 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432759  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0030  hypothetical protein  42.78 
 
 		 351 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2355  hypothetical protein  36.6 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0306  hypothetical protein  40.83 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2354  hypothetical protein  33.52 
 
 		 407 aa  229  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.815303  normal  0.0522931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3768  hypothetical protein  39.44 
 
 		 361 aa  229  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4488  hypothetical protein  41.41 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0713255  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3702  hypothetical protein  35.71 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12588  hypothetical protein  39.27 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2631  hypothetical protein  37.92 
 
 		 363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2370  hypothetical protein  38.29 
 
 		 358 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2323  hypothetical protein  38.29 
 
 		 358 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545047  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2362  hypothetical protein  38.02 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0481511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3310  hypothetical protein  38.51 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000271817  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4531  hypothetical protein  40.96 
 
 		 423 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0474681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4765  hypothetical protein  43.8 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3100  protein of unknown function UCP012641  37.68 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0191277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0374  hypothetical protein  38.56 
 
 		 321 aa  196  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1914  hypothetical protein  40.67 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2005  hypothetical protein  53.85 
 
 		 126 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5963  hypothetical protein  46.51 
 
 		 77 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440438  normal  0.282695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>