55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0374 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0374  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  663    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1914  hypothetical protein  87.81 
 
 
321 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2853  hypothetical protein  36.57 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2714  hypothetical protein  35.14 
 
 
352 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4904  hypothetical protein  34.38 
 
 
374 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.149118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3515  hypothetical protein  35.97 
 
 
366 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2838  hypothetical protein  35.97 
 
 
366 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3310  hypothetical protein  37.09 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000271817  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3607  hypothetical protein  39.59 
 
 
386 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176723  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2820  hypothetical protein  34.38 
 
 
358 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10809  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2597  hypothetical protein  34.38 
 
 
358 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0615  hypothetical protein  37.63 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5074  hypothetical protein  36.96 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3414  hypothetical protein  40.07 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  0.908388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3723  hypothetical protein  40.07 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  0.0498244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2247  hypothetical protein  40 
 
 
363 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3114  hypothetical protein  38.56 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3843  hypothetical protein  37.92 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394759  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12588  hypothetical protein  38.04 
 
 
341 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2030  protein of unknown function UCP012641  38.54 
 
 
387 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3768  hypothetical protein  36.69 
 
 
361 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2625  hypothetical protein  34.48 
 
 
354 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0657  hypothetical protein  36.95 
 
 
361 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3913  hypothetical protein  32.66 
 
 
390 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3661  hypothetical protein  36.36 
 
 
332 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.238992  normal  0.308547 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5998  hypothetical protein  33.24 
 
 
355 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2631  hypothetical protein  36.39 
 
 
363 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3100  protein of unknown function UCP012641  39.93 
 
 
336 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0191277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1804  hypothetical protein  34.16 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5369  hypothetical protein  38.54 
 
 
378 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2362  hypothetical protein  36.23 
 
 
358 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0481511  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2370  hypothetical protein  36.23 
 
 
358 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2323  hypothetical protein  36.23 
 
 
358 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3868  hypothetical protein  41.72 
 
 
359 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2071  protein of unknown function UCP012641  33.14 
 
 
359 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1620  hypothetical protein  35.57 
 
 
398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3036  hypothetical protein  33.71 
 
 
353 aa  178  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.898548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0438  hypothetical protein  38.21 
 
 
457 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2355  hypothetical protein  31.69 
 
 
354 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0306  hypothetical protein  34.71 
 
 
345 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3629  hypothetical protein  37.5 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1802  hypothetical protein  35.76 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102564  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1820  hypothetical protein  35.29 
 
 
388 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0779908  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02369  hypothetical protein  37.96 
 
 
355 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432759  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0773  hypothetical protein  38.65 
 
 
352 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0724  hypothetical protein  36.1 
 
 
467 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3702  hypothetical protein  37.33 
 
 
357 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3655  hypothetical protein  35.29 
 
 
388 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0030  hypothetical protein  39.73 
 
 
351 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4405  hypothetical protein  34.88 
 
 
409 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4531  hypothetical protein  35.27 
 
 
423 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0474681  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4488  hypothetical protein  36.59 
 
 
354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0713255  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2354  hypothetical protein  27.71 
 
 
407 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.815303  normal  0.0522931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4765  hypothetical protein  36.57 
 
 
279 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5963  hypothetical protein  54.29 
 
 
77 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440438  normal  0.282695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>