56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2323 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2362  hypothetical protein  99.72 
 
 
358 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0481511  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2323  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2370  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3768  hypothetical protein  82.45 
 
 
361 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2631  hypothetical protein  83.47 
 
 
363 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12588  hypothetical protein  72.51 
 
 
341 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3310  hypothetical protein  67.46 
 
 
341 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000271817  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3100  protein of unknown function UCP012641  64.29 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0191277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4904  hypothetical protein  45.41 
 
 
374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.149118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3036  hypothetical protein  46.59 
 
 
353 aa  298  8e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.898548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4405  hypothetical protein  44.7 
 
 
409 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1802  hypothetical protein  46.11 
 
 
388 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102564  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4488  hypothetical protein  46.61 
 
 
354 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0713255  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0724  hypothetical protein  44.29 
 
 
467 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3655  hypothetical protein  43.8 
 
 
388 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2853  hypothetical protein  45.71 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2714  hypothetical protein  44.19 
 
 
352 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1820  hypothetical protein  43.39 
 
 
388 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0779908  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3629  hypothetical protein  44.13 
 
 
425 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5074  hypothetical protein  42.54 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3702  hypothetical protein  42.13 
 
 
357 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0438  hypothetical protein  40.73 
 
 
457 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2071  protein of unknown function UCP012641  41.88 
 
 
359 aa  270  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1620  hypothetical protein  42.74 
 
 
398 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180132 
 
 
-
 
NC_003296  RS02369  hypothetical protein  43.84 
 
 
355 aa  269  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432759  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2355  hypothetical protein  40.06 
 
 
354 aa  268  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5998  hypothetical protein  41.64 
 
 
355 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3607  hypothetical protein  43.5 
 
 
386 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176723  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2354  hypothetical protein  38.15 
 
 
407 aa  265  5.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.815303  normal  0.0522931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2247  hypothetical protein  42.62 
 
 
363 aa  265  8e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2030  protein of unknown function UCP012641  41.89 
 
 
387 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0615  hypothetical protein  41.11 
 
 
356 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0657  hypothetical protein  40.82 
 
 
361 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3414  hypothetical protein  43.22 
 
 
386 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  0.908388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3723  hypothetical protein  43.22 
 
 
386 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  0.0498244 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0306  hypothetical protein  43.84 
 
 
345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2625  hypothetical protein  42.61 
 
 
354 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5369  hypothetical protein  43.06 
 
 
378 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554374  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2820  hypothetical protein  42.17 
 
 
358 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10809  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2597  hypothetical protein  42.17 
 
 
358 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4531  hypothetical protein  39.65 
 
 
423 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0474681  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3913  hypothetical protein  41.08 
 
 
390 aa  246  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2838  hypothetical protein  40.05 
 
 
366 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3515  hypothetical protein  39.95 
 
 
366 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0773  hypothetical protein  39.27 
 
 
352 aa  239  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3843  hypothetical protein  39.83 
 
 
359 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394759  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3114  hypothetical protein  39.17 
 
 
359 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3661  hypothetical protein  37.93 
 
 
332 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.238992  normal  0.308547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1804  hypothetical protein  35.42 
 
 
373 aa  216  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3868  hypothetical protein  40 
 
 
359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0030  hypothetical protein  39 
 
 
351 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4765  hypothetical protein  44.66 
 
 
279 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0374  hypothetical protein  36.69 
 
 
321 aa  192  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1914  hypothetical protein  34.63 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5963  hypothetical protein  61.4 
 
 
77 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440438  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2005  hypothetical protein  61.54 
 
 
126 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>