56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4904 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4904  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  776    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.149118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2853  hypothetical protein  70.29 
 
 		 352 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2714  hypothetical protein  70 
 
 		 352 aa  524  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2625  hypothetical protein  68.57 
 
 		 354 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2597  hypothetical protein  67.91 
 
 		 358 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2820  hypothetical protein  67.91 
 
 		 358 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10809  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3913  hypothetical protein  56.57 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2247  hypothetical protein  56.87 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5998  hypothetical protein  53.76 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3607  hypothetical protein  52.96 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176723  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3414  hypothetical protein  53.24 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  0.908388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3723  hypothetical protein  53.24 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  0.0498244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5074  hypothetical protein  51.37 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0615  hypothetical protein  51.39 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5369  hypothetical protein  53.01 
 
 		 378 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554374  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0657  hypothetical protein  50.97 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1620  hypothetical protein  49.73 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3036  hypothetical protein  49.43 
 
 		 353 aa  342  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.898548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4405  hypothetical protein  48.25 
 
 		 409 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2355  hypothetical protein  43.43 
 
 		 354 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2030  protein of unknown function UCP012641  46.01 
 
 		 387 aa  335  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3702  hypothetical protein  45.61 
 
 		 357 aa  334  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0724  hypothetical protein  47.81 
 
 		 467 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2354  hypothetical protein  41.6 
 
 		 407 aa  322  6e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.815303  normal  0.0522931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4488  hypothetical protein  46.35 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0713255  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_003296  RS02369  hypothetical protein  45.4 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432759  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0773  hypothetical protein  45.87 
 
 		 352 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1802  hypothetical protein  45.4 
 
 		 388 aa  298  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2071  protein of unknown function UCP012641  42.27 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3515  hypothetical protein  43.9 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3768  hypothetical protein  41.98 
 
 		 361 aa  292  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2838  hypothetical protein  43.63 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3868  hypothetical protein  43.05 
 
 		 359 aa  289  7e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3655  hypothetical protein  44.29 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2631  hypothetical protein  42.25 
 
 		 363 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2362  hypothetical protein  46.02 
 
 		 358 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0481511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3629  hypothetical protein  45.01 
 
 		 425 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1804  hypothetical protein  41.64 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2370  hypothetical protein  45.74 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2323  hypothetical protein  45.74 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0306  hypothetical protein  42.74 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1820  hypothetical protein  43.73 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0779908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3310  hypothetical protein  42.78 
 
 		 341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000271817  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0438  hypothetical protein  40.99 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3843  hypothetical protein  41.95 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4531  hypothetical protein  39.3 
 
 		 423 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0474681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3114  hypothetical protein  41 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0030  hypothetical protein  42.46 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12588  hypothetical protein  42.09 
 
 		 341 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3100  protein of unknown function UCP012641  43.43 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0191277  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3661  hypothetical protein  40.06 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.238992  normal  0.308547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4765  hypothetical protein  48.86 
 
 		 279 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0374  hypothetical protein  34.38 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1914  hypothetical protein  32.77 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5963  hypothetical protein  56.52 
 
 		 77 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440438  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2005  hypothetical protein  60.53 
 
 		 126 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>