55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1914 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1914  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  661    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0374  hypothetical protein  87.81 
 
 
321 aa  592  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2853  hypothetical protein  36.86 
 
 
352 aa  208  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3515  hypothetical protein  35.33 
 
 
366 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2838  hypothetical protein  34.88 
 
 
366 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2714  hypothetical protein  34.57 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5074  hypothetical protein  36.99 
 
 
378 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2030  protein of unknown function UCP012641  39.44 
 
 
387 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3843  hypothetical protein  40.67 
 
 
359 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394759  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4904  hypothetical protein  32.77 
 
 
374 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.149118 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3114  hypothetical protein  40 
 
 
359 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1804  hypothetical protein  40.14 
 
 
373 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0615  hypothetical protein  35.93 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3607  hypothetical protein  39.31 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176723  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3723  hypothetical protein  38.89 
 
 
386 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  0.0498244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3414  hypothetical protein  38.89 
 
 
386 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  0.908388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2820  hypothetical protein  34.48 
 
 
358 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10809  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2597  hypothetical protein  34.48 
 
 
358 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2247  hypothetical protein  39.52 
 
 
363 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3661  hypothetical protein  35.14 
 
 
332 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.238992  normal  0.308547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0657  hypothetical protein  35.25 
 
 
361 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2625  hypothetical protein  34.01 
 
 
354 aa  186  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5998  hypothetical protein  34.11 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5369  hypothetical protein  38.98 
 
 
378 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3913  hypothetical protein  31.81 
 
 
390 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0306  hypothetical protein  34.81 
 
 
345 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3868  hypothetical protein  40.97 
 
 
359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0438  hypothetical protein  37.54 
 
 
457 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2071  protein of unknown function UCP012641  32.94 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12588  hypothetical protein  35.08 
 
 
341 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3310  hypothetical protein  35.65 
 
 
341 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000271817  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3768  hypothetical protein  34.63 
 
 
361 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3629  hypothetical protein  36.95 
 
 
425 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_003296  RS02369  hypothetical protein  38.69 
 
 
355 aa  175  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432759  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1820  hypothetical protein  36.33 
 
 
388 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0779908  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3036  hypothetical protein  33.81 
 
 
353 aa  175  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.898548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3655  hypothetical protein  36.68 
 
 
388 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1620  hypothetical protein  35.63 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1802  hypothetical protein  36.09 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102564  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3100  protein of unknown function UCP012641  37.32 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0191277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2631  hypothetical protein  33.93 
 
 
363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0724  hypothetical protein  36 
 
 
467 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2355  hypothetical protein  31.1 
 
 
354 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2354  hypothetical protein  29.14 
 
 
407 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.815303  normal  0.0522931 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0773  hypothetical protein  38.43 
 
 
352 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4531  hypothetical protein  35.74 
 
 
423 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0474681  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3702  hypothetical protein  36.64 
 
 
357 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4405  hypothetical protein  35.64 
 
 
409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4488  hypothetical protein  37.23 
 
 
354 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0713255  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2362  hypothetical protein  34.21 
 
 
358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0481511  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2370  hypothetical protein  34.21 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2323  hypothetical protein  34.21 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545047  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0030  hypothetical protein  38.54 
 
 
351 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4765  hypothetical protein  36.57 
 
 
279 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5963  hypothetical protein  58.82 
 
 
77 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440438  normal  0.282695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>