55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5998 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5998  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  739    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2625  hypothetical protein  53.67 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2853  hypothetical protein  53.56 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2597  hypothetical protein  52.26 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2820  hypothetical protein  52.26 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10809  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4904  hypothetical protein  53.76 
 
 		 374 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.149118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2714  hypothetical protein  53.11 
 
 		 352 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2247  hypothetical protein  51.79 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3723  hypothetical protein  50.82 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  0.0498244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3414  hypothetical protein  50.82 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  0.908388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3607  hypothetical protein  51.91 
 
 		 386 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176723  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0615  hypothetical protein  52.25 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0657  hypothetical protein  52.26 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5074  hypothetical protein  50.42 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5369  hypothetical protein  52.79 
 
 		 378 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3913  hypothetical protein  48.57 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1620  hypothetical protein  48.91 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3702  hypothetical protein  47.03 
 
 		 357 aa  332  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2355  hypothetical protein  44.41 
 
 		 354 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3036  hypothetical protein  46.46 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.898548  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2354  hypothetical protein  42 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.815303  normal  0.0522931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3655  hypothetical protein  44.88 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0724  hypothetical protein  45.28 
 
 		 467 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4405  hypothetical protein  44.88 
 
 		 409 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2030  protein of unknown function UCP012641  45.14 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3515  hypothetical protein  43.67 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1820  hypothetical protein  44.6 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0779908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2838  hypothetical protein  43.4 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0773  hypothetical protein  47.18 
 
 		 352 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02369  hypothetical protein  44.72 
 
 		 355 aa  298  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432759  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1802  hypothetical protein  42.94 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0306  hypothetical protein  44.57 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3868  hypothetical protein  46.2 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3661  hypothetical protein  44.38 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.238992  normal  0.308547 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3114  hypothetical protein  44.38 
 
 		 359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3843  hypothetical protein  44.67 
 
 		 359 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3629  hypothetical protein  43.36 
 
 		 425 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4488  hypothetical protein  42.06 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0713255  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0438  hypothetical protein  41.13 
 
 		 457 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1804  hypothetical protein  41.32 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0030  hypothetical protein  44.41 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2071  protein of unknown function UCP012641  39.94 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3768  hypothetical protein  40.51 
 
 		 361 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3100  protein of unknown function UCP012641  43.1 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0191277  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2362  hypothetical protein  41.64 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0481511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2631  hypothetical protein  39.94 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2323  hypothetical protein  41.64 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2370  hypothetical protein  41.64 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12588  hypothetical protein  38.97 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4531  hypothetical protein  37.8 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0474681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3310  hypothetical protein  39.55 
 
 		 341 aa  245  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000271817  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4765  hypothetical protein  48.08 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0374  hypothetical protein  33.24 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1914  hypothetical protein  34.11 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5963  hypothetical protein  64.1 
 
 		 77 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440438  normal  0.282695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>