52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2005 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2005  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  256  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3629  hypothetical protein  64.1 
 
 
425 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5074  hypothetical protein  71.05 
 
 
378 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1802  hypothetical protein  58.97 
 
 
388 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102564  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2362  hypothetical protein  40.24 
 
 
358 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0481511  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2323  hypothetical protein  40.24 
 
 
358 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2370  hypothetical protein  40.24 
 
 
358 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3661  hypothetical protein  46.15 
 
 
332 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.238992  normal  0.308547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5369  hypothetical protein  68.42 
 
 
378 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554374  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12588  hypothetical protein  60.53 
 
 
341 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2631  hypothetical protein  58.97 
 
 
363 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3768  hypothetical protein  60.53 
 
 
361 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3036  hypothetical protein  40.24 
 
 
353 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.898548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0724  hypothetical protein  61.11 
 
 
467 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4904  hypothetical protein  60.53 
 
 
374 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.149118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2714  hypothetical protein  37.5 
 
 
352 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1820  hypothetical protein  56.41 
 
 
388 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0779908  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4405  hypothetical protein  61.11 
 
 
409 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3655  hypothetical protein  56.41 
 
 
388 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0773  hypothetical protein  61.11 
 
 
352 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0438  hypothetical protein  56.76 
 
 
457 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3607  hypothetical protein  43.9 
 
 
386 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176723  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3310  hypothetical protein  58.33 
 
 
341 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000271817  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3100  protein of unknown function UCP012641  56.41 
 
 
336 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0191277  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0615  hypothetical protein  41.56 
 
 
356 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2853  hypothetical protein  35 
 
 
352 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1620  hypothetical protein  63.16 
 
 
398 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4765  hypothetical protein  55.26 
 
 
279 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3723  hypothetical protein  44 
 
 
386 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  0.0498244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3414  hypothetical protein  44 
 
 
386 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  0.908388 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3114  hypothetical protein  53.85 
 
 
359 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4488  hypothetical protein  58.33 
 
 
354 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0713255  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3843  hypothetical protein  53.85 
 
 
359 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394759  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02369  hypothetical protein  60 
 
 
355 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432759  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0657  hypothetical protein  58.33 
 
 
361 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4531  hypothetical protein  54.05 
 
 
423 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0474681  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2820  hypothetical protein  52.63 
 
 
358 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10809  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2030  protein of unknown function UCP012641  54.05 
 
 
387 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2247  hypothetical protein  35 
 
 
363 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2597  hypothetical protein  52.63 
 
 
358 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2625  hypothetical protein  52.63 
 
 
354 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1804  hypothetical protein  54.05 
 
 
373 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2838  hypothetical protein  54.05 
 
 
366 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3515  hypothetical protein  54.05 
 
 
366 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0306  hypothetical protein  51.28 
 
 
345 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3868  hypothetical protein  56.76 
 
 
359 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2354  hypothetical protein  47.37 
 
 
407 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.815303  normal  0.0522931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3702  hypothetical protein  41.03 
 
 
357 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5998  hypothetical protein  33.75 
 
 
355 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3913  hypothetical protein  48.65 
 
 
390 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2071  protein of unknown function UCP012641  44.74 
 
 
359 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0030  hypothetical protein  52.78 
 
 
351 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>