56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0438 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0438  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  942    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3629  hypothetical protein  59.59 
 
 		 425 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1802  hypothetical protein  53.23 
 
 		 388 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3655  hypothetical protein  52.76 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1820  hypothetical protein  52.53 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0779908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4531  hypothetical protein  51.82 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0474681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2247  hypothetical protein  45.19 
 
 		 363 aa  320  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0724  hypothetical protein  45.11 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2030  protein of unknown function UCP012641  45.61 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3036  hypothetical protein  44.13 
 
 		 353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.898548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4405  hypothetical protein  43.95 
 
 		 409 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2355  hypothetical protein  42.71 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4488  hypothetical protein  45.13 
 
 		 354 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0713255  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_003296  RS02369  hypothetical protein  44.76 
 
 		 355 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432759  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3607  hypothetical protein  45.41 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176723  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2354  hypothetical protein  37.92 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.815303  normal  0.0522931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5074  hypothetical protein  45.05 
 
 		 378 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3723  hypothetical protein  44.67 
 
 		 386 aa  293  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  0.0498244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3414  hypothetical protein  44.67 
 
 		 386 aa  293  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  0.908388 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0773  hypothetical protein  42.93 
 
 		 352 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2071  protein of unknown function UCP012641  41.93 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5369  hypothetical protein  43.03 
 
 		 378 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2853  hypothetical protein  44.42 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2625  hypothetical protein  42.12 
 
 		 354 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2597  hypothetical protein  42.19 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2820  hypothetical protein  42.19 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10809  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5998  hypothetical protein  41.13 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0306  hypothetical protein  43.75 
 
 		 345 aa  280  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2714  hypothetical protein  42.97 
 
 		 352 aa  279  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1620  hypothetical protein  41.69 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3913  hypothetical protein  41.3 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3768  hypothetical protein  41.51 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4904  hypothetical protein  39.49 
 
 		 374 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.149118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2838  hypothetical protein  41.81 
 
 		 366 aa  273  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3515  hypothetical protein  41.71 
 
 		 366 aa  272  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3702  hypothetical protein  40.84 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2370  hypothetical protein  40.73 
 
 		 358 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2323  hypothetical protein  40.73 
 
 		 358 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545047  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2362  hypothetical protein  40.47 
 
 		 358 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0481511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1804  hypothetical protein  41.12 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0657  hypothetical protein  40.21 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0615  hypothetical protein  40.16 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2631  hypothetical protein  39.69 
 
 		 363 aa  259  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12588  hypothetical protein  39.16 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3843  hypothetical protein  40.68 
 
 		 359 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3868  hypothetical protein  41.93 
 
 		 359 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3114  hypothetical protein  39.95 
 
 		 359 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3100  protein of unknown function UCP012641  39.69 
 
 		 336 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0191277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0030  hypothetical protein  41.36 
 
 		 351 aa  243  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3310  hypothetical protein  39.32 
 
 		 341 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000271817  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3661  hypothetical protein  38.79 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.238992  normal  0.308547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4765  hypothetical protein  43.93 
 
 		 279 aa  206  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1914  hypothetical protein  37.54 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0374  hypothetical protein  38.21 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2005  hypothetical protein  56.76 
 
 		 126 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5963  hypothetical protein  45.65 
 
 		 77 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440438  normal  0.282695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>