57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0306 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0306  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  706    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0724  hypothetical protein  47.08 
 
 
467 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4488  hypothetical protein  46.91 
 
 
354 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0713255  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4405  hypothetical protein  46.24 
 
 
409 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0773  hypothetical protein  49.86 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3036  hypothetical protein  47.44 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.898548  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3629  hypothetical protein  46.39 
 
 
425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2355  hypothetical protein  43.71 
 
 
354 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5074  hypothetical protein  45.86 
 
 
378 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5369  hypothetical protein  47.37 
 
 
378 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554374  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02369  hypothetical protein  46.35 
 
 
355 aa  299  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432759  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2853  hypothetical protein  45.58 
 
 
352 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2071  protein of unknown function UCP012641  45.15 
 
 
359 aa  296  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5998  hypothetical protein  44.13 
 
 
355 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2030  protein of unknown function UCP012641  45.53 
 
 
387 aa  292  7e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1620  hypothetical protein  45.11 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3414  hypothetical protein  43.99 
 
 
386 aa  285  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  0.908388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3723  hypothetical protein  43.99 
 
 
386 aa  285  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  0.0498244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2714  hypothetical protein  43.59 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2625  hypothetical protein  42.61 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2820  hypothetical protein  41.31 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10809  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2597  hypothetical protein  41.31 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3607  hypothetical protein  42.9 
 
 
386 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176723  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4904  hypothetical protein  41.99 
 
 
374 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.149118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0438  hypothetical protein  43.04 
 
 
457 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2354  hypothetical protein  41.03 
 
 
407 aa  279  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.815303  normal  0.0522931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1802  hypothetical protein  43.06 
 
 
388 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102564  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1820  hypothetical protein  43.21 
 
 
388 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0779908  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3655  hypothetical protein  43.49 
 
 
388 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4531  hypothetical protein  40.79 
 
 
423 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0474681  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3913  hypothetical protein  43.14 
 
 
390 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0615  hypothetical protein  42.86 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0657  hypothetical protein  42.86 
 
 
361 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2247  hypothetical protein  44.57 
 
 
363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2838  hypothetical protein  43.01 
 
 
366 aa  268  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3515  hypothetical protein  42.74 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3868  hypothetical protein  43.87 
 
 
359 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12588  hypothetical protein  44.19 
 
 
341 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0030  hypothetical protein  46.52 
 
 
351 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3702  hypothetical protein  39.22 
 
 
357 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3310  hypothetical protein  40.8 
 
 
341 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000271817  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2370  hypothetical protein  43.35 
 
 
358 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2323  hypothetical protein  43.35 
 
 
358 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3768  hypothetical protein  41.71 
 
 
361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1804  hypothetical protein  40.37 
 
 
373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2631  hypothetical protein  42.29 
 
 
363 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2362  hypothetical protein  42.77 
 
 
358 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0481511  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3100  protein of unknown function UCP012641  41.69 
 
 
336 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0191277  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3661  hypothetical protein  41.93 
 
 
332 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.238992  normal  0.308547 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3843  hypothetical protein  40.82 
 
 
359 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394759  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3114  hypothetical protein  40.4 
 
 
359 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4765  hypothetical protein  43.19 
 
 
279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1914  hypothetical protein  34.81 
 
 
321 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0374  hypothetical protein  34.71 
 
 
321 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5963  hypothetical protein  38.78 
 
 
77 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440438  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1550  hypothetical protein  37.5 
 
 
337 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2005  hypothetical protein  51.28 
 
 
126 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>