56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3414 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3414  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  797    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  0.908388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3723  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  797    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal  0.0498244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3607  hypothetical protein  89.09 
 
 		 386 aa  725    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176723  normal  0.385885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1620  hypothetical protein  66.67 
 
 		 398 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5074  hypothetical protein  61.73 
 
 		 378 aa  474  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5369  hypothetical protein  63.68 
 
 		 378 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554374  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2597  hypothetical protein  55.31 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2820  hypothetical protein  55.31 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10809  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2625  hypothetical protein  54.47 
 
 		 354 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3913  hypothetical protein  52.12 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2247  hypothetical protein  54.25 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2853  hypothetical protein  54.21 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2714  hypothetical protein  53.65 
 
 		 352 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4904  hypothetical protein  53.24 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.149118 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5998  hypothetical protein  50.82 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0615  hypothetical protein  49.86 
 
 		 356 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.518336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0657  hypothetical protein  49.04 
 
 		 361 aa  348  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3036  hypothetical protein  47.62 
 
 		 353 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.898548  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2030  protein of unknown function UCP012641  47.54 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3702  hypothetical protein  46.28 
 
 		 357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2354  hypothetical protein  43.75 
 
 		 407 aa  324  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.815303  normal  0.0522931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2355  hypothetical protein  42.9 
 
 		 354 aa  316  5e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0724  hypothetical protein  48.34 
 
 		 467 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02369  hypothetical protein  49.73 
 
 		 355 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432759  normal  0.0499255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4405  hypothetical protein  47.79 
 
 		 409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0773  hypothetical protein  47.01 
 
 		 352 aa  310  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4488  hypothetical protein  46.15 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0713255  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1802  hypothetical protein  44.41 
 
 		 388 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0438  hypothetical protein  44.67 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1820  hypothetical protein  44.29 
 
 		 388 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0779908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2838  hypothetical protein  43.65 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2071  protein of unknown function UCP012641  43.13 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3515  hypothetical protein  43.39 
 
 		 366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3655  hypothetical protein  44.14 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1804  hypothetical protein  41.62 
 
 		 373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3629  hypothetical protein  44.69 
 
 		 425 aa  279  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.283791 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0306  hypothetical protein  43.85 
 
 		 345 aa  279  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3868  hypothetical protein  43.9 
 
 		 359 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0030  hypothetical protein  45.43 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3768  hypothetical protein  43.42 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3100  protein of unknown function UCP012641  43.63 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0191277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2631  hypothetical protein  43.85 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3114  hypothetical protein  41.08 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2362  hypothetical protein  42.98 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0481511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2323  hypothetical protein  43.26 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2370  hypothetical protein  43.26 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3843  hypothetical protein  40.44 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4765  hypothetical protein  50 
 
 		 279 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402909  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12588  hypothetical protein  41.24 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3310  hypothetical protein  41.67 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000271817  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4531  hypothetical protein  37.75 
 
 		 423 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0474681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3661  hypothetical protein  38.74 
 
 		 332 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.238992  normal  0.308547 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0374  hypothetical protein  40.07 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1914  hypothetical protein  38.89 
 
 		 321 aa  190  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5963  hypothetical protein  51.92 
 
 		 77 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440438  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2005  hypothetical protein  44 
 
 		 126 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>