More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4092 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4092  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  759    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.143855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2342  glycosyl transferase family protein  44.32 
 
 
471 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0316  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
360 aa  166  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.767969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1270  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.989667  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3131  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1884  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 
365 aa  160  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0349  glycosyl transferase family 4  35.74 
 
 
366 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.281434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0627  glycosyl transferase family 4  33.75 
 
 
363 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726036  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0689  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase transmembrane protein  31.96 
 
 
373 aa  156  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155123  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2502  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590155  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2288  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
366 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1484  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  32.01 
 
 
368 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0903  glycosyl transferase family 4  31.6 
 
 
366 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0772  glycosyl transferase family 4  33.85 
 
 
365 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2069  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
368 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.2071  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2196  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
368 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3088  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.01 
 
 
368 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3149  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
368 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0711  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
368 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3125  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.01 
 
 
368 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2545  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
368 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0778  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
368 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0767  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
368 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0409  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
368 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0858  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
368 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0888  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
368 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3985  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
368 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4714  glycosyl transferase family 4  31.52 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1886  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
362 aa  146  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4140  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 
367 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000022778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3998  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
368 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0567  glycosyl transferase family 4  33.43 
 
 
364 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0618  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
373 aa  144  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0261116 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0647  glycosyl transferase family protein  36.03 
 
 
357 aa  143  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.029233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0587  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493903  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3732  putative undecaprenyl phosphate N- acetylglucosaminyltransferase  31.29 
 
 
366 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1320  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1227  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  27.86 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000798419  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.17 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.67 
 
 
360 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0630  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  33.52 
 
 
364 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.336958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
591 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  29.64 
 
 
399 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.3 
 
 
600 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  31.92 
 
 
366 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
371 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
357 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.32 
 
 
427 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  30.9 
 
 
404 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
399 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
399 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1209  glycosyl transferase family 4  30.49 
 
 
449 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
399 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 
353 aa  100  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  31.43 
 
 
351 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.05 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
495 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.3 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
357 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.3 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 
369 aa  94.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.3 
 
 
357 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.3 
 
 
357 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  31.3 
 
 
357 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3031  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  28.02 
 
 
350 aa  92.8  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.111205  normal  0.0113432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3243  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  26.45 
 
 
354 aa  92.8  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.27 
 
 
347 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0808  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
360 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.326327  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.74 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.51 
 
 
375 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0731  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.78 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.3 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.3 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1083  glycosyltransferase, group 4 family  29.07 
 
 
367 aa  90.9  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.41 
 
 
403 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  30.68 
 
 
340 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  25.25 
 
 
329 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  29.05 
 
 
312 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2161  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
462 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  30.45 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  34.46 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
496 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1662  glycosyltransferase  31.43 
 
 
425 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  32.44 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  29.59 
 
 
357 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  31.73 
 
 
394 aa  86.3  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2133  ATPase  27.78 
 
 
351 aa  86.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085223  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
380 aa  86.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000019692  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  26.94 
 
 
405 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.27 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1755  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.01 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0725  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  30.37 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>