More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2288 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2288  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
366 aa  729    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0903  glycosyl transferase family 4  89.89 
 
 
366 aa  630  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3732  putative undecaprenyl phosphate N- acetylglucosaminyltransferase  89.07 
 
 
366 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0858  glycosyl transferase family protein  82.47 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0409  glycosyl transferase family protein  82.47 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0767  glycosyl transferase family protein  82.74 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0888  glycosyl transferase family protein  82.47 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0778  glycosyl transferase family protein  82.74 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3088  glycosyl transferase, group 4 family protein  83.52 
 
 
368 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3125  glycosyl transferase, group 4 family protein  83.52 
 
 
368 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2196  glycosyl transferase family protein  83.52 
 
 
368 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3149  glycosyl transferase family protein  83.52 
 
 
368 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3985  glycosyl transferase family protein  80.93 
 
 
368 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1484  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  83.29 
 
 
368 aa  584  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2069  glycosyl transferase family protein  83.52 
 
 
368 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.2071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2545  glycosyl transferase family protein  83.52 
 
 
368 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0711  glycosyl transferase family protein  83.52 
 
 
368 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2502  glycosyl transferase family protein  81.92 
 
 
368 aa  577  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590155  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0627  glycosyl transferase family 4  62.53 
 
 
363 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726036  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0689  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase transmembrane protein  58.01 
 
 
373 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155123  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1270  glycosyl transferase family protein  53.61 
 
 
373 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.989667  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0349  glycosyl transferase family 4  48.91 
 
 
366 aa  354  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.281434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0618  glycosyl transferase family protein  52.78 
 
 
373 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0261116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4714  glycosyl transferase family 4  48.48 
 
 
378 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0630  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  53.02 
 
 
364 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.336958 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0567  glycosyl transferase family 4  43.18 
 
 
364 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4140  glycosyl transferase family protein  43.37 
 
 
367 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000022778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1227  glycosyl transferase family protein  44.32 
 
 
366 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0772  glycosyl transferase family 4  41.32 
 
 
365 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0316  glycosyl transferase family protein  39.23 
 
 
360 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.767969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0587  glycosyl transferase family protein  44.2 
 
 
366 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493903  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1320  glycosyl transferase family protein  42.27 
 
 
367 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3998  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
368 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1884  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3131  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
367 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1886  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 
362 aa  210  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0647  glycosyl transferase family protein  36.83 
 
 
357 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.029233  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4092  hypothetical protein  31.72 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.143855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2342  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
471 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  31.54 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
348 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.93 
 
 
600 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  29.9 
 
 
351 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.67 
 
 
380 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
351 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
351 aa  103  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  30.68 
 
 
349 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 
542 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  27.43 
 
 
340 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  33.09 
 
 
372 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  29.21 
 
 
348 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.76 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  32.22 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  31.28 
 
 
312 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  31.42 
 
 
357 aa  97.1  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  31.56 
 
 
360 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.79 
 
 
441 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.5 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  31.25 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.8 
 
 
385 aa  93.6  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
353 aa  93.6  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.65 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.93 
 
 
353 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.03 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
357 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.03 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  29.03 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.64 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
591 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.64 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.82 
 
 
359 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
545 aa  90.1  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  26.44 
 
 
366 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  28.77 
 
 
491 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
496 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1975  putative glycosyl transferase, family 4  40 
 
 
176 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0974645 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.44 
 
 
391 aa  86.3  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  0.000000374023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
521 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  31.13 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  31.13 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  24.3 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0725  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0401  glycosyl transferase family 4  26.47 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  31.06 
 
 
762 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  27.06 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.2 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
495 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  28.91 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.99 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1083  glycosyltransferase, group 4 family  26.71 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  25.55 
 
 
554 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.29 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2670  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.91 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0836071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.29 
 
 
357 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>