More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0778 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3985  glycosyl transferase family protein  95.11 
 
 
368 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212346 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0409  glycosyl transferase family protein  97.82 
 
 
368 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0778  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
368 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2502  glycosyl transferase family protein  97.28 
 
 
368 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590155  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0767  glycosyl transferase family protein  99.73 
 
 
368 aa  730    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0858  glycosyl transferase family protein  97.82 
 
 
368 aa  687    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0888  glycosyl transferase family protein  97.82 
 
 
368 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1484  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase  84.93 
 
 
368 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2288  glycosyl transferase family protein  82.74 
 
 
366 aa  591  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2545  glycosyl transferase family protein  84.62 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3088  glycosyl transferase, group 4 family protein  84.62 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2196  glycosyl transferase family protein  84.62 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3149  glycosyl transferase family protein  84.62 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2069  glycosyl transferase family protein  84.62 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.2071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0711  glycosyl transferase family protein  84.62 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.152511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3125  glycosyl transferase, group 4 family protein  84.62 
 
 
368 aa  591  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0903  glycosyl transferase family 4  84.15 
 
 
366 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3732  putative undecaprenyl phosphate N- acetylglucosaminyltransferase  82.79 
 
 
366 aa  564  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0627  glycosyl transferase family 4  61.98 
 
 
363 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726036  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0689  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase transmembrane protein  58.29 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155123  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1270  glycosyl transferase family protein  53.76 
 
 
373 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.989667  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0349  glycosyl transferase family 4  52.19 
 
 
366 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.281434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0618  glycosyl transferase family protein  52.38 
 
 
373 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0261116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4714  glycosyl transferase family 4  47.92 
 
 
378 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0630  putative undecaprenyl phosphate N-acetylglucosaminyltransferase  53.02 
 
 
364 aa  319  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.336958 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4140  glycosyl transferase family protein  44.6 
 
 
367 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000022778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0567  glycosyl transferase family 4  42.62 
 
 
364 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0772  glycosyl transferase family 4  42.11 
 
 
365 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0316  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 
360 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.767969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0587  glycosyl transferase family protein  43.61 
 
 
366 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493903  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1227  glycosyl transferase family protein  42.94 
 
 
366 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3998  glycosyl transferase family protein  41.48 
 
 
368 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1320  glycosyl transferase family protein  41.83 
 
 
367 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3131  glycosyl transferase family protein  41.52 
 
 
367 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1884  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 
365 aa  223  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0647  glycosyl transferase family protein  39.41 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.029233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1886  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 
362 aa  209  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2342  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
471 aa  149  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4092  hypothetical protein  32.78 
 
 
395 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.143855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  30.58 
 
 
354 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  31.91 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  33.84 
 
 
357 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3046  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  28.83 
 
 
600 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.014062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  29.83 
 
 
351 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  26.67 
 
 
340 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.12 
 
 
386 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
372 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2161  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
591 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.57 
 
 
380 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000828029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  32.7 
 
 
349 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  29.77 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000368413  hitchhiker  0.000004636 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.64 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000790838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
542 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  27.76 
 
 
393 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  30.04 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  27.25 
 
 
360 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.19 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  29.79 
 
 
441 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
545 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 
357 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
349 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  32.55 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  32.55 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
496 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  32.32 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.72 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
357 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.72 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405483 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  28.72 
 
 
357 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.37 
 
 
353 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.37 
 
 
357 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.37 
 
 
357 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
357 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  28.74 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000955005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  29.07 
 
 
312 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  30.53 
 
 
762 aa  87  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 
495 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
521 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2670  glycosyl transferase, group 4 family protein  27.64 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0836071  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  29.53 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1769  glycosyl transferase family 4  28.93 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0297431  normal  0.100208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1975  putative glycosyl transferase, family 4  38.46 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0974645 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.32 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1417  undecaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphatetransferase  27.95 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0272  glycosyl transferase family 4  29.62 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.57 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  27.99 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.77 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.72 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000033302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0167  glycosyltransferase/acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase  24.73 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0422469  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  28.72 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>