103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3033 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3033  ureidoglycolate hydrolase  100 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0204  ureidoglycolate hydrolase  87.73 
 
 		 163 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1552  ureidoglycolate hydrolase  87.73 
 
 		 163 aa  283  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3474  ureidoglycolate hydrolase  65.03 
 
 		 168 aa  220  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2607  ureidoglycolate hydrolase  64.97 
 
 		 171 aa  216  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3203  ureidoglycolatehydrolase  56.25 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.742581  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2829  ureidoglycolate hydrolase  54.78 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6194  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4312  ureidoglycolate hydrolase  53.16 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3010  ureidoglycolate hydrolase  54.9 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2059  ureidoglycolate hydrolase  55.21 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1740  ureidoglycolate hydrolase  53.66 
 
 		 165 aa  163  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1073  ureidoglycolate hydrolase  54.6 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  hitchhiker  0.00893742 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7820  ureidoglycolate hydrolase  52.53 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0556  ureidoglycolate hydrolase  48.41 
 
 		 170 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770931  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3341  ureidoglycolate hydrolase  49.38 
 
 		 169 aa  154  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2103  ureidoglycolate hydrolase  54.61 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3471  ureidoglycolate hydrolase  47.24 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3144  ureidoglycolate hydrolase  47.24 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401114  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0507  ureidoglycolate hydrolase  47.47 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0510  ureidoglycolate hydrolase  47.47 
 
 		 169 aa  144  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3149  ureidoglycolate hydrolase  45.81 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4491  ureidoglycolate hydrolase  46.58 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1875  ureidoglycolate hydrolase  47.13 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  0.0633216 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1948  ureidoglycolate hydrolase  46.5 
 
 		 170 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5275  ureidoglycolate hydrolase  45.22 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0821095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3821  ureidoglycolate hydrolase  46.75 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0694  ureidoglycolate hydrolase  45.57 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1984  ureidoglycolate hydrolase  45.86 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.272161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1929  ureidoglycolate hydrolase  45.22 
 
 		 170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1310  ureidoglycolate hydrolase  46.75 
 
 		 170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167955 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6117  ureidoglycolate hydrolase  45.86 
 
 		 170 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1960  ureidoglycolate hydrolase  45.86 
 
 		 170 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44860  ureidoglycolate hydrolase  46.1 
 
 		 169 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1504  ureidoglycolate hydrolase  45.22 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2530  ureidoglycolate hydrolase  45.22 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0205659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2004  ureidoglycolate hydrolase  45.22 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3306  ureidoglycolate hydrolase  45.22 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2385  ureidoglycolate hydrolase  45.22 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2429  ureidoglycolate hydrolase  45.22 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1276  ureidoglycolate hydrolase  45.22 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.296224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3669  ureidoglycolate hydrolase  44.37 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1703  ureidoglycolate hydrolase  45.03 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.914773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2885  ureidoglycolate hydrolase  45.16 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2326  ureidoglycolate hydrolase  43.95 
 
 		 170 aa  133  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.344354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3614  ureidoglycolate hydrolase  43.23 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4288  ureidoglycolate hydrolase  42.58 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.823504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1580  ureidoglycolate hydrolase  42.58 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3852  ureidoglycolate hydrolase  42.58 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137447  normal  0.795271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2760  ureidoglycolate hydrolase  43.23 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.437798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5077  ureidoglycolate hydrolase  47.97 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663593  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1297  ureidoglycolate hydrolase  45.52 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2070  ureidoglycolate hydrolase  44.1 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1806  ureidoglycolate hydrolase  42.31 
 
 		 170 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0543  ureidoglycolate hydrolase  44.38 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0517381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0302  ureidoglycolate hydrolase  41.88 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2594  ureidoglycolate hydrolase  41.51 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000285655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4871  ureidoglycolate hydrolase  38.36 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0615  ureidoglycolate hydrolase  45.12 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.637445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2738  ureidoglycolate hydrolase  43.83 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.307574  normal  0.841531 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0569  ureidoglycolate hydrolase  43.12 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0165  ureidoglycolate hydrolase  44.51 
 
 		 177 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0648  ureidoglycolate hydrolase  44.51 
 
 		 177 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3386  ureidoglycolate hydrolase  41.77 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000095826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3734  ureidoglycolate hydrolase  43.12 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0570  ureidoglycolate hydrolase  43.51 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0080  ureidoglycolate hydrolase  45.21 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21100  ureidoglycolate hydrolase  44.37 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3456  ureidoglycolate hydrolase  42.24 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5333  ureidoglycolate hydrolase  40.51 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835232  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3458  ureidoglycolate hydrolase  42.5 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1205  ureidoglycolate hydrolase  42.33 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3421  ureidoglycolate hydrolase  41.88 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153458  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1341  Ureidoglycolate hydrolase  40.88 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00058678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1402  ureidoglycolate hydrolase  48.99 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0548  ureidoglycolate hydrolase  41.67 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00455  ureidoglycolate hydrolase  40.97 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0579  ureidoglycolate hydrolase  40.97 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3117  ureidoglycolate hydrolase  40.97 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0439  ureidoglycolate hydrolase  40.97 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0401643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00460  hypothetical protein  40.97 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0606  ureidoglycolate hydrolase  40.97 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0542  ureidoglycolate hydrolase  40.97 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3107  Ureidoglycolate hydrolase  40.28 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0569  ureidoglycolate hydrolase  38.19 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0623  ureidoglycolate hydrolase  38.19 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0916386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0562  ureidoglycolate hydrolase  38.19 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0564  ureidoglycolate hydrolase  38.19 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.787947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0386  ureidoglycolate hydrolase  40.38 
 
 		 210 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3375  ureidoglycolate hydrolase  40.67 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0207  ureidoglycolate hydrolase  43.54 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0846  Ureidoglycolate hydrolase  40.14 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1920  ureidoglycolate hydrolase  32.7 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0376  ureidoglycolate hydrolase  39.62 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1235  ureidoglycolate hydrolase  39.62 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43701  ureidoglycolate hydrolase  33.12 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0187342  normal  0.177859 
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  28.31 
 
 		 814 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4115  putative ureidoglycolate hydrolase  31.94 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0377  ureidoglycolate hydrolase  48 
 
 		 57 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1236  ureidoglycolate hydrolase  48 
 
 		 57 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4467  ureidoglycolate hydrolase-like  31.25 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>