98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1235 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3458  ureidoglycolate hydrolase  99.14 
 
 
174 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0376  ureidoglycolate hydrolase  100 
 
 
116 aa  235  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1235  ureidoglycolate hydrolase  100 
 
 
116 aa  235  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3456  ureidoglycolate hydrolase  98.28 
 
 
174 aa  234  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3421  ureidoglycolate hydrolase  97.41 
 
 
174 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1205  ureidoglycolate hydrolase  95.69 
 
 
174 aa  228  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0569  ureidoglycolate hydrolase  74.78 
 
 
174 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0543  ureidoglycolate hydrolase  73.28 
 
 
180 aa  180  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0517381  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2738  ureidoglycolate hydrolase  72.17 
 
 
174 aa  177  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.307574  normal  0.841531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0615  ureidoglycolate hydrolase  72.17 
 
 
177 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.637445  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3734  ureidoglycolate hydrolase  71.93 
 
 
183 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0648  ureidoglycolate hydrolase  72.17 
 
 
177 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0165  ureidoglycolate hydrolase  72.17 
 
 
177 aa  176  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0570  ureidoglycolate hydrolase  73.68 
 
 
170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3386  ureidoglycolate hydrolase  74.77 
 
 
170 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000095826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2594  ureidoglycolate hydrolase  71.7 
 
 
170 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000285655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1875  ureidoglycolate hydrolase  58.62 
 
 
170 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  0.0633216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3471  ureidoglycolate hydrolase  65 
 
 
175 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3144  ureidoglycolate hydrolase  64 
 
 
175 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401114  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1929  ureidoglycolate hydrolase  58.12 
 
 
170 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.46818  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1948  ureidoglycolate hydrolase  59.82 
 
 
170 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5275  ureidoglycolate hydrolase  57.76 
 
 
170 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0821095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1984  ureidoglycolate hydrolase  57.76 
 
 
170 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.272161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1297  ureidoglycolate hydrolase  64 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144736  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1960  ureidoglycolate hydrolase  57.76 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6117  ureidoglycolate hydrolase  57.76 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2070  ureidoglycolate hydrolase  57.76 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1504  ureidoglycolate hydrolase  59.82 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2429  ureidoglycolate hydrolase  59.82 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2385  ureidoglycolate hydrolase  59.82 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1276  ureidoglycolate hydrolase  59.82 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.296224  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2326  ureidoglycolate hydrolase  59.82 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.344354 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3306  ureidoglycolate hydrolase  59.82 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2004  ureidoglycolate hydrolase  59.82 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2530  ureidoglycolate hydrolase  59.82 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0205659  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1310  ureidoglycolate hydrolase  61.86 
 
 
170 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0167955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4871  ureidoglycolate hydrolase  55.88 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1341  Ureidoglycolate hydrolase  52.48 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00058678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0080  ureidoglycolate hydrolase  53.27 
 
 
162 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3669  ureidoglycolate hydrolase  48.18 
 
 
170 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0694  ureidoglycolate hydrolase  49.54 
 
 
169 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5077  ureidoglycolate hydrolase  51.72 
 
 
177 aa  110  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663593  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0302  ureidoglycolate hydrolase  54.46 
 
 
173 aa  110  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1806  ureidoglycolate hydrolase  49.09 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0510  ureidoglycolate hydrolase  51.38 
 
 
169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44860  ureidoglycolate hydrolase  48.18 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3821  ureidoglycolate hydrolase  48.18 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2885  ureidoglycolate hydrolase  48.08 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_004310  BR0507  ureidoglycolate hydrolase  51.38 
 
 
169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1703  ureidoglycolate hydrolase  46.3 
 
 
167 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.914773  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21100  ureidoglycolate hydrolase  56.12 
 
 
166 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2760  ureidoglycolate hydrolase  51.02 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.437798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4288  ureidoglycolate hydrolase  45.45 
 
 
167 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.823504  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3852  ureidoglycolate hydrolase  45.45 
 
 
167 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137447  normal  0.795271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1580  ureidoglycolate hydrolase  45.45 
 
 
167 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190987  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4491  ureidoglycolate hydrolase  49.5 
 
 
168 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3149  ureidoglycolate hydrolase  47.12 
 
 
173 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3614  ureidoglycolate hydrolase  45.45 
 
 
167 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13515  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0569  ureidoglycolate hydrolase  48.96 
 
 
160 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0623  ureidoglycolate hydrolase  48.96 
 
 
160 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0916386  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0562  ureidoglycolate hydrolase  48.96 
 
 
160 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0564  ureidoglycolate hydrolase  48.96 
 
 
160 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.787947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3341  ureidoglycolate hydrolase  44.86 
 
 
169 aa  99.4  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0439  ureidoglycolate hydrolase  46.88 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0401643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00460  hypothetical protein  46.88 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3117  ureidoglycolate hydrolase  46.88 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0606  ureidoglycolate hydrolase  46.88 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00455  ureidoglycolate hydrolase  46.88 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3107  Ureidoglycolate hydrolase  46.88 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0579  ureidoglycolate hydrolase  46.88 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0542  ureidoglycolate hydrolase  46.88 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0548  ureidoglycolate hydrolase  45.83 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5333  ureidoglycolate hydrolase  51.49 
 
 
161 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835232  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1920  ureidoglycolate hydrolase  43.75 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2829  ureidoglycolate hydrolase  38.68 
 
 
165 aa  87.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0846  Ureidoglycolate hydrolase  47.71 
 
 
173 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4312  ureidoglycolate hydrolase  44.34 
 
 
163 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0556  ureidoglycolate hydrolase  46.15 
 
 
170 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3010  ureidoglycolate hydrolase  41.51 
 
 
170 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22054  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2059  ureidoglycolate hydrolase  45.19 
 
 
165 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1740  ureidoglycolate hydrolase  44.23 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7820  ureidoglycolate hydrolase  39.62 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0207  ureidoglycolate hydrolase  44.34 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2607  ureidoglycolate hydrolase  38.68 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1402  ureidoglycolate hydrolase  44.33 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3033  ureidoglycolate hydrolase  39.62 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1073  ureidoglycolate hydrolase  42.31 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  hitchhiker  0.00893742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1552  ureidoglycolate hydrolase  39.62 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0204  ureidoglycolate hydrolase  39.62 
 
 
163 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2103  ureidoglycolate hydrolase  42 
 
 
159 aa  76.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3474  ureidoglycolate hydrolase  38.53 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177168  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3203  ureidoglycolatehydrolase  36.36 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.742581  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0386  ureidoglycolate hydrolase  39.77 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  31.48 
 
 
814 aa  61.6  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43701  ureidoglycolate hydrolase  30.48 
 
 
214 aa  55.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0187342  normal  0.177859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3375  ureidoglycolate hydrolase  39.33 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01480  ureidoglycolate hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04760)  33.33 
 
 
255 aa  54.7  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4115  putative ureidoglycolate hydrolase  38.2 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>