101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0556 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0556  ureidoglycolate hydrolase  100 
 
 		 170 aa  346  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3010  ureidoglycolate hydrolase  73.49 
 
 		 170 aa  258  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2059  ureidoglycolate hydrolase  71.43 
 
 		 165 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1740  ureidoglycolate hydrolase  68.32 
 
 		 165 aa  229  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1073  ureidoglycolate hydrolase  67.66 
 
 		 165 aa  226  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  hitchhiker  0.00893742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2829  ureidoglycolate hydrolase  62.11 
 
 		 165 aa  225  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6194  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4312  ureidoglycolate hydrolase  55.41 
 
 		 163 aa  187  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7820  ureidoglycolate hydrolase  55.35 
 
 		 163 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3149  ureidoglycolate hydrolase  49.35 
 
 		 173 aa  167  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3341  ureidoglycolate hydrolase  46.95 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4491  ureidoglycolate hydrolase  45.45 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1984  ureidoglycolate hydrolase  46.58 
 
 		 170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.272161 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6117  ureidoglycolate hydrolase  46.58 
 
 		 170 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1960  ureidoglycolate hydrolase  46.58 
 
 		 170 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3033  ureidoglycolate hydrolase  48.41 
 
 		 164 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1875  ureidoglycolate hydrolase  45.96 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  0.0633216 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1948  ureidoglycolate hydrolase  45.34 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0204  ureidoglycolate hydrolase  48.41 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1552  ureidoglycolate hydrolase  48.41 
 
 		 163 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5275  ureidoglycolate hydrolase  45.81 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0821095 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3474  ureidoglycolate hydrolase  46.25 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0694  ureidoglycolate hydrolase  45.1 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1310  ureidoglycolate hydrolase  44.1 
 
 		 170 aa  147  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1297  ureidoglycolate hydrolase  44.24 
 
 		 169 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0080  ureidoglycolate hydrolase  48.67 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2885  ureidoglycolate hydrolase  48.7 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_004310  BR0507  ureidoglycolate hydrolase  43.79 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0510  ureidoglycolate hydrolase  43.79 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1504  ureidoglycolate hydrolase  45.62 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2530  ureidoglycolate hydrolase  45.62 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0205659  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2070  ureidoglycolate hydrolase  49.32 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2004  ureidoglycolate hydrolase  45.62 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3306  ureidoglycolate hydrolase  45.62 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2385  ureidoglycolate hydrolase  45.62 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2429  ureidoglycolate hydrolase  45.62 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1276  ureidoglycolate hydrolase  45.62 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.296224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0302  ureidoglycolate hydrolase  44.03 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2607  ureidoglycolate hydrolase  46.5 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2326  ureidoglycolate hydrolase  42.42 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.344354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1929  ureidoglycolate hydrolase  41.82 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3471  ureidoglycolate hydrolase  43.64 
 
 		 175 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3144  ureidoglycolate hydrolase  43.64 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2103  ureidoglycolate hydrolase  44.97 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0543  ureidoglycolate hydrolase  44.87 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0517381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5077  ureidoglycolate hydrolase  47.26 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663593  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3386  ureidoglycolate hydrolase  41.46 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000095826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2594  ureidoglycolate hydrolase  44 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000285655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0615  ureidoglycolate hydrolase  44.03 
 
 		 177 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.637445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44860  ureidoglycolate hydrolase  42.31 
 
 		 169 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0569  ureidoglycolate hydrolase  44.23 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3821  ureidoglycolate hydrolase  41.67 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2738  ureidoglycolate hydrolase  44.23 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.307574  normal  0.841531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1806  ureidoglycolate hydrolase  39.88 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0570  ureidoglycolate hydrolase  42.31 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0165  ureidoglycolate hydrolase  45.03 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0648  ureidoglycolate hydrolase  45.03 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3456  ureidoglycolate hydrolase  45 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2760  ureidoglycolate hydrolase  38.65 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.437798 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3203  ureidoglycolatehydrolase  38.51 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.742581  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21100  ureidoglycolate hydrolase  41.72 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3458  ureidoglycolate hydrolase  45 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1703  ureidoglycolate hydrolase  40.38 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.914773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3734  ureidoglycolate hydrolase  42.41 
 
 		 183 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3669  ureidoglycolate hydrolase  39.1 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5333  ureidoglycolate hydrolase  43.75 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835232  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4871  ureidoglycolate hydrolase  35.12 
 
 		 170 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1205  ureidoglycolate hydrolase  44.38 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3421  ureidoglycolate hydrolase  44.38 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3614  ureidoglycolate hydrolase  38.65 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4288  ureidoglycolate hydrolase  38.04 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.823504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1580  ureidoglycolate hydrolase  38.04 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3852  ureidoglycolate hydrolase  38.04 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137447  normal  0.795271 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0548  ureidoglycolate hydrolase  41.96 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00455  ureidoglycolate hydrolase  41.26 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0579  ureidoglycolate hydrolase  41.26 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3117  ureidoglycolate hydrolase  41.26 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0439  ureidoglycolate hydrolase  41.26 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0401643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0606  ureidoglycolate hydrolase  41.26 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00460  hypothetical protein  41.26 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0542  ureidoglycolate hydrolase  41.26 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0569  ureidoglycolate hydrolase  39.16 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0623  ureidoglycolate hydrolase  39.16 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0916386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0562  ureidoglycolate hydrolase  39.16 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0564  ureidoglycolate hydrolase  39.16 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.787947 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3107  Ureidoglycolate hydrolase  40.56 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1341  Ureidoglycolate hydrolase  39.62 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00058678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1402  ureidoglycolate hydrolase  43.36 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1920  ureidoglycolate hydrolase  34.5 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0376  ureidoglycolate hydrolase  46.15 
 
 		 116 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1235  ureidoglycolate hydrolase  46.15 
 
 		 116 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0207  ureidoglycolate hydrolase  41.96 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0846  Ureidoglycolate hydrolase  38.93 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3375  ureidoglycolate hydrolase  35 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0386  ureidoglycolate hydrolase  31.97 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4115  putative ureidoglycolate hydrolase  34 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  30.54 
 
 		 814 aa  54.3  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43701  ureidoglycolate hydrolase  30.32 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0187342  normal  0.177859 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0377  ureidoglycolate hydrolase  46.81 
 
 		 57 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1236  ureidoglycolate hydrolase  46.81 
 
 		 57 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01480  ureidoglycolate hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04760)  25.77 
 
 		 255 aa  42  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>