84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0377 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1236  ureidoglycolate hydrolase  100 
 
 		 57 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0377  ureidoglycolate hydrolase  100 
 
 		 57 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3458  ureidoglycolate hydrolase  98.25 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3421  ureidoglycolate hydrolase  98.25 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3456  ureidoglycolate hydrolase  98.25 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1205  ureidoglycolate hydrolase  94.74 
 
 		 174 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2738  ureidoglycolate hydrolase  77.19 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.307574  normal  0.841531 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0569  ureidoglycolate hydrolase  73.68 
 
 		 174 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3386  ureidoglycolate hydrolase  74.07 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000095826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0543  ureidoglycolate hydrolase  73.68 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0517381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3734  ureidoglycolate hydrolase  73.68 
 
 		 183 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0570  ureidoglycolate hydrolase  74.07 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0615  ureidoglycolate hydrolase  71.93 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.637445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0648  ureidoglycolate hydrolase  71.93 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0165  ureidoglycolate hydrolase  71.93 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2594  ureidoglycolate hydrolase  72.22 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000285655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1960  ureidoglycolate hydrolase  70.37 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6117  ureidoglycolate hydrolase  70.37 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1984  ureidoglycolate hydrolase  68.52 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.272161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1297  ureidoglycolate hydrolase  66.67 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2070  ureidoglycolate hydrolase  68.52 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1875  ureidoglycolate hydrolase  66.67 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  0.0633216 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1948  ureidoglycolate hydrolase  66.67 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2530  ureidoglycolate hydrolase  66.67 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0205659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3306  ureidoglycolate hydrolase  66.67 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2004  ureidoglycolate hydrolase  66.67 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1504  ureidoglycolate hydrolase  66.67 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2385  ureidoglycolate hydrolase  66.67 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2429  ureidoglycolate hydrolase  66.67 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1276  ureidoglycolate hydrolase  66.67 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.296224  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1310  ureidoglycolate hydrolase  64.81 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5275  ureidoglycolate hydrolase  62.96 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0821095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2326  ureidoglycolate hydrolase  62.96 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.344354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3471  ureidoglycolate hydrolase  69.23 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3144  ureidoglycolate hydrolase  67.31 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1929  ureidoglycolate hydrolase  59.26 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0507  ureidoglycolate hydrolase  65.22 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0510  ureidoglycolate hydrolase  65.22 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44860  ureidoglycolate hydrolase  52 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3341  ureidoglycolate hydrolase  60 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0694  ureidoglycolate hydrolase  65.22 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0302  ureidoglycolate hydrolase  62.22 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3614  ureidoglycolate hydrolase  50 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3821  ureidoglycolate hydrolase  50 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3669  ureidoglycolate hydrolase  48.15 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1703  ureidoglycolate hydrolase  56.52 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.914773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4491  ureidoglycolate hydrolase  56 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3149  ureidoglycolate hydrolase  60 
 
 		 173 aa  57  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1580  ureidoglycolate hydrolase  48.15 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3852  ureidoglycolate hydrolase  48.15 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137447  normal  0.795271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4288  ureidoglycolate hydrolase  48.15 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.823504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1806  ureidoglycolate hydrolase  46.3 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1341  Ureidoglycolate hydrolase  52 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00058678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2829  ureidoglycolate hydrolase  58.54 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21100  ureidoglycolate hydrolase  42.59 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279715  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7820  ureidoglycolate hydrolase  45.28 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2760  ureidoglycolate hydrolase  40.74 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.437798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0080  ureidoglycolate hydrolase  52.94 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3010  ureidoglycolate hydrolase  50.98 
 
 		 170 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3033  ureidoglycolate hydrolase  48 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1073  ureidoglycolate hydrolase  48 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  hitchhiker  0.00893742 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5077  ureidoglycolate hydrolase  52.27 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663593  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4312  ureidoglycolate hydrolase  40.38 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5333  ureidoglycolate hydrolase  48.08 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835232  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2607  ureidoglycolate hydrolase  48.08 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4871  ureidoglycolate hydrolase  44.9 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2059  ureidoglycolate hydrolase  46 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1740  ureidoglycolate hydrolase  44 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0606  ureidoglycolate hydrolase  43.48 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2885  ureidoglycolate hydrolase  62.16 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0556  ureidoglycolate hydrolase  46.81 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00455  ureidoglycolate hydrolase  43.48 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00460  hypothetical protein  43.48 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0439  ureidoglycolate hydrolase  43.48 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0401643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0548  ureidoglycolate hydrolase  43.48 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3117  ureidoglycolate hydrolase  43.48 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0542  ureidoglycolate hydrolase  43.48 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0579  ureidoglycolate hydrolase  43.48 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0204  ureidoglycolate hydrolase  46.15 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1402  ureidoglycolate hydrolase  38.89 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1552  ureidoglycolate hydrolase  46.15 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3107  Ureidoglycolate hydrolase  43.48 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3203  ureidoglycolatehydrolase  42.31 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.742581  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3474  ureidoglycolate hydrolase  42.55 
 
 		 168 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>