104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1580 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4288  ureidoglycolate hydrolase  100 
 
 		 167 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.823504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1580  ureidoglycolate hydrolase  100 
 
 		 167 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3852  ureidoglycolate hydrolase  100 
 
 		 167 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137447  normal  0.795271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3614  ureidoglycolate hydrolase  98.8 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1703  ureidoglycolate hydrolase  89.82 
 
 		 167 aa  315  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.914773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2760  ureidoglycolate hydrolase  86.23 
 
 		 167 aa  307  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.437798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1806  ureidoglycolate hydrolase  84.94 
 
 		 170 aa  298  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3821  ureidoglycolate hydrolase  83.13 
 
 		 169 aa  296  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3669  ureidoglycolate hydrolase  84.34 
 
 		 170 aa  294  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44860  ureidoglycolate hydrolase  83.13 
 
 		 169 aa  295  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21100  ureidoglycolate hydrolase  69.51 
 
 		 166 aa  241  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279715  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3471  ureidoglycolate hydrolase  54.55 
 
 		 175 aa  180  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1948  ureidoglycolate hydrolase  53.42 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1310  ureidoglycolate hydrolase  52.41 
 
 		 170 aa  178  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167955 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0694  ureidoglycolate hydrolase  53.5 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1875  ureidoglycolate hydrolase  52.8 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  0.0633216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1929  ureidoglycolate hydrolase  50.93 
 
 		 170 aa  177  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3144  ureidoglycolate hydrolase  54.55 
 
 		 175 aa  177  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401114  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1504  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2530  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0205659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2004  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3306  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2385  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2429  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1276  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.296224  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5275  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  177  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0821095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2594  ureidoglycolate hydrolase  55.92 
 
 		 170 aa  177  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000285655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2326  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.344354 
 
 
-
 
NC_004310  BR0507  ureidoglycolate hydrolase  53.16 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0510  ureidoglycolate hydrolase  53.16 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1984  ureidoglycolate hydrolase  52.17 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.272161 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6117  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1960  ureidoglycolate hydrolase  51.55 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1297  ureidoglycolate hydrolase  49.7 
 
 		 169 aa  173  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2070  ureidoglycolate hydrolase  49.42 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0570  ureidoglycolate hydrolase  48.78 
 
 		 170 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3386  ureidoglycolate hydrolase  49.69 
 
 		 170 aa  168  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000095826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0302  ureidoglycolate hydrolase  51.81 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00455  ureidoglycolate hydrolase  51.59 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00460  hypothetical protein  51.59 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0579  ureidoglycolate hydrolase  51.59 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0542  ureidoglycolate hydrolase  51.59 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3117  ureidoglycolate hydrolase  51.59 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0439  ureidoglycolate hydrolase  51.59 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0401643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0606  ureidoglycolate hydrolase  51.59 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0548  ureidoglycolate hydrolase  51.59 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3107  Ureidoglycolate hydrolase  51.59 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2829  ureidoglycolate hydrolase  50.96 
 
 		 165 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5077  ureidoglycolate hydrolase  48.99 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663593  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1205  ureidoglycolate hydrolase  49.67 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3456  ureidoglycolate hydrolase  46.06 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4871  ureidoglycolate hydrolase  50 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3458  ureidoglycolate hydrolase  46.06 
 
 		 174 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0080  ureidoglycolate hydrolase  53.9 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0569  ureidoglycolate hydrolase  53.38 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0623  ureidoglycolate hydrolase  53.38 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0916386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0562  ureidoglycolate hydrolase  53.38 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0564  ureidoglycolate hydrolase  53.38 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.787947 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7820  ureidoglycolate hydrolase  49.08 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4491  ureidoglycolate hydrolase  49.7 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3734  ureidoglycolate hydrolase  47.85 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0543  ureidoglycolate hydrolase  47.85 
 
 		 180 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0517381  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0165  ureidoglycolate hydrolase  47.85 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0648  ureidoglycolate hydrolase  47.85 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3421  ureidoglycolate hydrolase  45.45 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0569  ureidoglycolate hydrolase  47.24 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2738  ureidoglycolate hydrolase  49.02 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.307574  normal  0.841531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0615  ureidoglycolate hydrolase  47.24 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.637445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1341  Ureidoglycolate hydrolase  52.67 
 
 		 169 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00058678  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3341  ureidoglycolate hydrolase  46.3 
 
 		 169 aa  154  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4312  ureidoglycolate hydrolase  48.72 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3149  ureidoglycolate hydrolase  46.91 
 
 		 173 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.983522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2885  ureidoglycolate hydrolase  47.53 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.11874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3033  ureidoglycolate hydrolase  42.58 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5333  ureidoglycolate hydrolase  42.68 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835232  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1073  ureidoglycolate hydrolase  42.33 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  hitchhiker  0.00893742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3010  ureidoglycolate hydrolase  44.23 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1740  ureidoglycolate hydrolase  42.86 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2059  ureidoglycolate hydrolase  42.24 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1552  ureidoglycolate hydrolase  42.58 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2607  ureidoglycolate hydrolase  46.1 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0204  ureidoglycolate hydrolase  43.71 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3474  ureidoglycolate hydrolase  40.62 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1402  ureidoglycolate hydrolase  46.71 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0556  ureidoglycolate hydrolase  38.04 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770931  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1920  ureidoglycolate hydrolase  38.69 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2103  ureidoglycolate hydrolase  44.44 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0376  ureidoglycolate hydrolase  45.45 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1235  ureidoglycolate hydrolase  45.45 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0207  ureidoglycolate hydrolase  41.29 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3203  ureidoglycolatehydrolase  38.12 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.742581  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0846  Ureidoglycolate hydrolase  38.93 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0386  ureidoglycolate hydrolase  37.75 
 
 		 210 aa  89  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  31.95 
 
 		 814 aa  76.3  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43701  ureidoglycolate hydrolase  31.38 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0187342  normal  0.177859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3375  ureidoglycolate hydrolase  33.57 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0377  ureidoglycolate hydrolase  48.15 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1236  ureidoglycolate hydrolase  48.15 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4467  ureidoglycolate hydrolase-like  32.82 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01480  ureidoglycolate hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04760)  29.55 
 
 		 255 aa  51.2  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>