59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4467 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4467  ureidoglycolate hydrolase-like  100 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3375  ureidoglycolate hydrolase  32.39 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1703  ureidoglycolate hydrolase  33.59 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.914773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3669  ureidoglycolate hydrolase  31.82 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3107  Ureidoglycolate hydrolase  42.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00460  hypothetical protein  42.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0606  ureidoglycolate hydrolase  42.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0439  ureidoglycolate hydrolase  42.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0401643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3614  ureidoglycolate hydrolase  33.59 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3117  ureidoglycolate hydrolase  42.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0542  ureidoglycolate hydrolase  42.86 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0579  ureidoglycolate hydrolase  42.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00455  ureidoglycolate hydrolase  42.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3852  ureidoglycolate hydrolase  32.82 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137447  normal  0.795271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4288  ureidoglycolate hydrolase  32.82 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.823504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1580  ureidoglycolate hydrolase  32.82 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0548  ureidoglycolate hydrolase  42.86 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1740  ureidoglycolate hydrolase  29.38 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0623  ureidoglycolate hydrolase  34.91 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0916386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0569  ureidoglycolate hydrolase  34.91 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0564  ureidoglycolate hydrolase  34.91 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.787947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0562  ureidoglycolate hydrolase  34.91 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2059  ureidoglycolate hydrolase  30.94 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1806  ureidoglycolate hydrolase  30.3 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1276  ureidoglycolate hydrolase  29.68 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.296224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2530  ureidoglycolate hydrolase  29.68 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0205659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1504  ureidoglycolate hydrolase  29.68 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2429  ureidoglycolate hydrolase  29.68 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2385  ureidoglycolate hydrolase  29.68 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88317  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3306  ureidoglycolate hydrolase  29.68 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2004  ureidoglycolate hydrolase  29.68 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2829  ureidoglycolate hydrolase  29.32 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6194  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1073  ureidoglycolate hydrolase  30.43 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  hitchhiker  0.00893742 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0204  ureidoglycolate hydrolase  28.14 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1552  ureidoglycolate hydrolase  28.14 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2607  ureidoglycolate hydrolase  30.52 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1310  ureidoglycolate hydrolase  27.4 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3821  ureidoglycolate hydrolase  27.48 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3033  ureidoglycolate hydrolase  31.25 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  36.99 
 
 		 814 aa  46.2  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3010  ureidoglycolate hydrolase  28.03 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3474  ureidoglycolate hydrolase  28.48 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1875  ureidoglycolate hydrolase  29.01 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  0.0633216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44860  ureidoglycolate hydrolase  27.48 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1948  ureidoglycolate hydrolase  29.01 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0921  hypothetical protein  28.12 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0778  hypothetical protein  28.12 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0080  ureidoglycolate hydrolase  29.55 
 
 		 162 aa  44.3  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1984  ureidoglycolate hydrolase  29.77 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.272161 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1960  ureidoglycolate hydrolase  29.77 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6117  ureidoglycolate hydrolase  29.77 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2760  ureidoglycolate hydrolase  27.61 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.437798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2070  ureidoglycolate hydrolase  30.53 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0846  Ureidoglycolate hydrolase  27.7 
 
 		 173 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1080  hypothetical protein  30.41 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.0256519 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7820  ureidoglycolate hydrolase  28.21 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0386  ureidoglycolate hydrolase  29.5 
 
 		 210 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1929  ureidoglycolate hydrolase  24.66 
 
 		 170 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0556  ureidoglycolate hydrolase  27.69 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>