11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0778 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0921  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0778  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  400  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1080  hypothetical protein  26.14 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.0256519 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1552  ureidoglycolate hydrolase  31.13 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.991333  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0204  ureidoglycolate hydrolase  33.01 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4467  ureidoglycolate hydrolase-like  28.12 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0888  hypothetical protein  30.14 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000142126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3033  ureidoglycolate hydrolase  30.1 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2103  ureidoglycolate hydrolase  30.86 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.287519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2059  ureidoglycolate hydrolase  38.1 
 
 		 165 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0695819  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2607  ureidoglycolate hydrolase  30.85 
 
 		 171 aa  41.2  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>