62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1080 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1080  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  345  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.0256519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1948  hypothetical protein  43.75 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.626737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0518  hypothetical protein  40.49 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0888  hypothetical protein  46.58 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000142126 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3951  hypothetical protein  40.62 
 
 		 139 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1349  hypothetical protein  42.03 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.441771  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119593  conserved protein of unknown function  40.88 
 
 		 195 aa  97.4  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00737675  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0528  hypothetical protein  40.3 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0126203  normal  0.578413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0302  ureidoglycolate hydrolase  36.84 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0778  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0921  hypothetical protein  26.14 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1703  ureidoglycolate hydrolase  31.94 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.914773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3375  ureidoglycolate hydrolase  36.29 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1806  ureidoglycolate hydrolase  34.09 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1310  ureidoglycolate hydrolase  32.64 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0167955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2594  ureidoglycolate hydrolase  31.78 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000285655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1984  ureidoglycolate hydrolase  34.53 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.272161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21100  ureidoglycolate hydrolase  32.06 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279715  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6117  ureidoglycolate hydrolase  34.53 
 
 		 170 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1960  ureidoglycolate hydrolase  34.53 
 
 		 170 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3614  ureidoglycolate hydrolase  32.06 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1948  ureidoglycolate hydrolase  33.59 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0510  ureidoglycolate hydrolase  33.8 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44860  ureidoglycolate hydrolase  33.33 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3669  ureidoglycolate hydrolase  28.57 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0080  ureidoglycolate hydrolase  31.65 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5275  ureidoglycolate hydrolase  33.09 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0821095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3144  ureidoglycolate hydrolase  35.92 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401114  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0507  ureidoglycolate hydrolase  33.8 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1875  ureidoglycolate hydrolase  33.81 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  0.0633216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2760  ureidoglycolate hydrolase  31.65 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.437798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3852  ureidoglycolate hydrolase  31.3 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137447  normal  0.795271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0846  Ureidoglycolate hydrolase  32.54 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0694  ureidoglycolate hydrolase  31.69 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1580  ureidoglycolate hydrolase  31.3 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4288  ureidoglycolate hydrolase  31.3 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.823504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2070  ureidoglycolate hydrolase  34.11 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3821  ureidoglycolate hydrolase  32.58 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1276  ureidoglycolate hydrolase  32.64 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.296224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2429  ureidoglycolate hydrolase  32.64 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1504  ureidoglycolate hydrolase  32.64 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.494507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2385  ureidoglycolate hydrolase  32.64 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2530  ureidoglycolate hydrolase  32.64 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0205659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3306  ureidoglycolate hydrolase  32.64 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2004  ureidoglycolate hydrolase  32.64 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0207  ureidoglycolate hydrolase  32.31 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2829  ureidoglycolate hydrolase  29.66 
 
 		 165 aa  44.3  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6194  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1297  ureidoglycolate hydrolase  29.33 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3471  ureidoglycolate hydrolase  36.62 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1929  ureidoglycolate hydrolase  31.94 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4491  ureidoglycolate hydrolase  28.68 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2326  ureidoglycolate hydrolase  30.94 
 
 		 170 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.344354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5077  ureidoglycolate hydrolase  28.67 
 
 		 177 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663593  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3474  ureidoglycolate hydrolase  28.46 
 
 		 168 aa  42  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.177168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3734  ureidoglycolate hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4467  ureidoglycolate hydrolase-like  30.41 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3033  ureidoglycolate hydrolase  31.54 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3341  ureidoglycolate hydrolase  30.87 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2738  ureidoglycolate hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.307574  normal  0.841531 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0165  ureidoglycolate hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0648  ureidoglycolate hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0569  ureidoglycolate hydrolase  32.56 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>