90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2068 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2068  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 213 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  94.84 
 
 		 213 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  94.37 
 
 		 213 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  42.86 
 
 		 212 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  41.4 
 
 		 229 aa  134  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.18 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  33.5 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.95 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.91 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  36.15 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  34.42 
 
 		 243 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  33.04 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  33.95 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  34.22 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  32.69 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  34.86 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.05 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.69 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.02 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  32.7 
 
 		 261 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  31.88 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.73 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  28.97 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  30.14 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.13 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  34.78 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  27.83 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  31.98 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.06 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.48 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.95 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.81 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  30 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.91 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.86 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  27.57 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  27.57 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  27.57 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.37 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  30.37 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.23 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  29.44 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  30.37 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  30 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  30.37 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  34.97 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  30 
 
 		 327 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  30 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  30 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  30.81 
 
 		 318 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  30 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  30.23 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  32.91 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  28.64 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  31.56 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  36.81 
 
 		 267 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  34.17 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  30.19 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.5 
 
 		 256 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  32.89 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02830  nitrogen metabolism-related protein, putative  27.16 
 
 		 276 aa  52.4  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0852649  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 		 627 aa  52  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  28 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  27.23 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0955  hydantoin racemase  30.58 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.63 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.63 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2468  Asp/Glu racemase  30.22 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  32.07 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  34.27 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.01 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.85 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  32.29 
 
 		 246 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  30.51 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.6 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  32.37 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  34.78 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  30.35 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31723  predicted protein  25.79 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  0.555446 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5144  Asp/Glu racemase  32.09 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238464  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1409  Asp/Glu racemase  30.17 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0168107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.34 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3252  hypothetical protein  34.67 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  27.97 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.57 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0439  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.43 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  26.49 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  26.88 
 
 		 245 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  29.5 
 
 		 245 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  26.7 
 
 		 258 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>