124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1988 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 		 263 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  98.48 
 
 		 263 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  98.48 
 
 		 263 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  97.34 
 
 		 263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  88.53 
 
 		 279 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  88.85 
 
 		 278 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  89.21 
 
 		 278 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  80.49 
 
 		 287 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  91.36 
 
 		 280 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  91.36 
 
 		 327 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  91.36 
 
 		 280 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  91.36 
 
 		 280 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  91.36 
 
 		 280 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  91.36 
 
 		 318 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  85.38 
 
 		 288 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  85.38 
 
 		 288 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  88.84 
 
 		 285 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  65.7 
 
 		 244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  66.12 
 
 		 245 aa  321  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  65.98 
 
 		 261 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  62.81 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  62.71 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  56.61 
 
 		 243 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  57.69 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  56.52 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  52.48 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  52.48 
 
 		 243 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  49.79 
 
 		 245 aa  242  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  53.06 
 
 		 243 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.05 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.05 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  48.76 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  54.32 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  55.14 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.01 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  50.83 
 
 		 247 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.92 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  52.97 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  49.38 
 
 		 243 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  53.5 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  50.43 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  46.96 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  48.28 
 
 		 236 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  56.83 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  47.98 
 
 		 220 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  47.98 
 
 		 220 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  47.98 
 
 		 220 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  40.08 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.25 
 
 		 242 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  40.74 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  41.1 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  39 
 
 		 242 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  40.68 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  40.68 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.68 
 
 		 240 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  40.25 
 
 		 242 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  40.25 
 
 		 242 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.83 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.53 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  38.98 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  36.4 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  36.24 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  35.44 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.92 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  37.31 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.76 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  33.63 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.19 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  34.02 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  40.59 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  35.62 
 
 		 627 aa  105  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.64 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.64 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  32.34 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.79 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  31.62 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  38.61 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  28.83 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.997842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  32.17 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  35.35 
 
 		 212 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  33.33 
 
 		 227 aa  96.3  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  37.93 
 
 		 205 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  26.88 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.02 
 
 		 250 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.06 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.54 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.31 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  30.2 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  35.46 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.31 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.37 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  30.56 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1409  Asp/Glu racemase  27.88 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0168107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.11 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.32 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  31.13 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  29.67 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5137  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.06 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  29.18 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2261  racemase, putative  28.34 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>