121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3376 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  74.49 
 
 		 247 aa  340  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  56.96 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  57.2 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  56.78 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.94 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  55.08 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  55.27 
 
 		 245 aa  241  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.59 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  54.66 
 
 		 288 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  53.81 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  53.81 
 
 		 279 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  53.81 
 
 		 263 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  53.81 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.39 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.81 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  54.66 
 
 		 288 aa  238  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.97 
 
 		 263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.12 
 
 		 285 aa  231  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  54.82 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  51.69 
 
 		 287 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  52.97 
 
 		 261 aa  225  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  50.62 
 
 		 243 aa  224  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  50 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.85 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  50.42 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  50.42 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  50.42 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  50.42 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  50.42 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  54.74 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  50.42 
 
 		 318 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  53.62 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  49.15 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.27 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  47.84 
 
 		 236 aa  211  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.27 
 
 		 247 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  49.15 
 
 		 245 aa  211  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  47.39 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  50.85 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  47.92 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  52.32 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  49.58 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  41.6 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.44 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  41.77 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  40.93 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.74 
 
 		 242 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.51 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  40.08 
 
 		 242 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  40.08 
 
 		 242 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  41.25 
 
 		 242 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.19 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  50.45 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  50.45 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  50.45 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  40.34 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  40.34 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.34 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  41.98 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  35.83 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.02 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  36.44 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  35.39 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  44.57 
 
 		 205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  39.11 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  40.1 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.37 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.37 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.92 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.47 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.64 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  32.64 
 
 		 627 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  30.77 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  32.17 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  34.04 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  32.62 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  37.36 
 
 		 205 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  33.8 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  36.84 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  34.29 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  33.17 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.93 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.5 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  27.85 
 
 		 266 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.997842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  35.58 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2068  Asp/Glu racemase  35.55 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  36.7 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  34.6 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  34.6 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  38.17 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  43.75 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  30.09 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.47 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  24.58 
 
 		 259 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  30 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  25.11 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  31.02 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.66 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0955  hydantoin racemase  31.98 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>