122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3633 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  417  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  81.59 
 
 
218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  81.38 
 
 
205 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  49.53 
 
 
243 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  45.33 
 
 
232 aa  170  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  45.37 
 
 
241 aa  161  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  44.91 
 
 
236 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  46.98 
 
 
247 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  46.05 
 
 
247 aa  154  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  43.46 
 
 
243 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  43.46 
 
 
243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  43.78 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  41.12 
 
 
243 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  46.79 
 
 
227 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  44.6 
 
 
243 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  42.72 
 
 
243 aa  148  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.86 
 
 
278 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.47 
 
 
245 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.94 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.94 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  41.94 
 
 
279 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  41.94 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  41.94 
 
 
263 aa  134  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  41.94 
 
 
263 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  41.94 
 
 
263 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.4 
 
 
288 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  41.94 
 
 
288 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  45.12 
 
 
258 aa  131  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  40 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  42.38 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  40.95 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  41.59 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  40.55 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  39.25 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.23 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.93 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  39.63 
 
 
280 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  39.63 
 
 
280 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  39.63 
 
 
280 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  39.63 
 
 
280 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  39.63 
 
 
327 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  39.63 
 
 
318 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.55 
 
 
244 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.29 
 
 
242 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.94 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  37.85 
 
 
242 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  40.47 
 
 
238 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.53 
 
 
253 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.39 
 
 
242 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.14 
 
 
240 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  38.6 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.38 
 
 
240 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  38.14 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  38.14 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  37.39 
 
 
242 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  37.39 
 
 
242 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.82 
 
 
247 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  35.59 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  37.39 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.41 
 
 
252 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  34.69 
 
 
258 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  41.47 
 
 
220 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  41.47 
 
 
220 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  41.47 
 
 
220 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  40.22 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  32.38 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  30.52 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  36.17 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  31.98 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  31.28 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  31.08 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  32.26 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  30.45 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.36 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.92 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  33.49 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  32.13 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.14 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.63 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.63 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  30.09 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02830  nitrogen metabolism-related protein, putative  31.56 
 
 
276 aa  63.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0852649  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  31.25 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5283  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.29 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.05 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.68 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  31.84 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1238  putative racemase  30.43 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205483  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.44 
 
 
239 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5914  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.14 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  28.99 
 
 
279 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.35 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.36 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  30.29 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0955  hydantoin racemase  32.88 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.49 
 
 
251 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31723  predicted protein  23.83 
 
 
230 aa  58.5  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490385  normal  0.555446 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  29.91 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.13 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  29.96 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>