47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0439 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0439  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1687  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.76 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0637223  normal  0.422323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0208  Asp/Glu racemase  44.44 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.509232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4169  Asp/Glu/hydantoin racemase  46.97 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000394216  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  29.12 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  31.54 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  25.56 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  27.49 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  33.96 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  26.78 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  30.94 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  30.94 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  30.94 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  30.94 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  30.94 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  30.94 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.32 
 
 		 285 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  29.38 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  30.77 
 
 		 288 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.15 
 
 		 278 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  31.03 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  31.69 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.77 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.15 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  31.15 
 
 		 279 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  31.15 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  31.03 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  31.15 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  31.15 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  26.16 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  24.86 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  24.86 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  24.86 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  25.53 
 
 		 247 aa  45.1  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  30.66 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.05 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  30.66 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  24.12 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  27.01 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  28.57 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2068  Asp/Glu racemase  30.43 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.8 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.28 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.96 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.28 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.47 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  36.36 
 
 		 253 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>