64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1687 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1687  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 		 221 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0637223  normal  0.422323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4169  Asp/Glu/hydantoin racemase  60 
 
 		 213 aa  184  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000394216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0208  Asp/Glu racemase  51.74 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.509232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0439  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.75 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  31.28 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.28 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.28 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  30.3 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.32 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  31.28 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.59 
 
 		 278 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  31.28 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  29.59 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  27.93 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  31.63 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  34.62 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  30.84 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  28.57 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.41 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  31.29 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  29.63 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  32 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  32 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.1 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  31.34 
 
 		 327 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  31.34 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  31.21 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  31.34 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  31.34 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  31.34 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  30.39 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  31.34 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  35.86 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  30 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.52 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.52 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  30.04 
 
 		 288 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.51 
 
 		 226 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.69 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  28.65 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  31.51 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  29.23 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  31.51 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  31.51 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  27.96 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  31.25 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.49 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.88 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2068  Asp/Glu racemase  30.41 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4489  hypothetical protein  38.67 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.15 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  36.31 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.48 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  28.82 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  28.39 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  27.12 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  28.83 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  33.73 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  30.26 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.6 
 
 		 288 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  30.99 
 
 		 245 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.98 
 
 		 244 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  42 
 
 		 262 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  28.57 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>