126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1486 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  100 
 
 
229 aa  461  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  48.79 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.56 
 
 
226 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  42.23 
 
 
213 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  42.23 
 
 
213 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2068  Asp/Glu racemase  41.75 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  34.98 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.6 
 
 
245 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  35.07 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  34.56 
 
 
287 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.63 
 
 
278 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  34.56 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  34.56 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  33.63 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  34.56 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  34.56 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  34.56 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  34.56 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.63 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.63 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  33.63 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  33.63 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  33.18 
 
 
263 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.98 
 
 
244 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  32.59 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.88 
 
 
288 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  32.88 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  33.49 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  34.82 
 
 
243 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.82 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.07 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.74 
 
 
285 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  36.02 
 
 
247 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  36.54 
 
 
238 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.62 
 
 
247 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.49 
 
 
245 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.93 
 
 
247 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  32.88 
 
 
243 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  30.63 
 
 
243 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.59 
 
 
250 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.15 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.84 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  31.96 
 
 
243 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  31.07 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  31.22 
 
 
243 aa  95.5  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  32.29 
 
 
239 aa  95.5  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.62 
 
 
253 aa  95.5  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  29.85 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.77 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  34.78 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  33.8 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  31.87 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  33.95 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.33 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  35.15 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.33 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  28.77 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  27.78 
 
 
242 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.41 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  34.15 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  35.23 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  27.85 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  27.85 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.82 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.56 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  34.15 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.85 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.82 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  29.52 
 
 
220 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  29.52 
 
 
220 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  29.52 
 
 
220 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  29.36 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  29.36 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.86 
 
 
251 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  32.68 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  26.39 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.4 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  26.39 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  32.21 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.11 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  30.08 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 
627 aa  82  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.51 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  28.64 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  28.44 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  30.77 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.98 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.31 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2261  racemase, putative  29.73 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113318  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  35.38 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  32.73 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02830  nitrogen metabolism-related protein, putative  28 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0852649  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1238  putative racemase  31.25 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205483  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5144  Asp/Glu racemase  30.73 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  29.44 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  31.74 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  31.9 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.18 
 
 
247 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  29.52 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.77 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>