More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1172 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1172  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.920146  normal  0.661058 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2636  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  95.7 
 
 
186 aa  358  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1293  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  95.7 
 
 
186 aa  358  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2170  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  81.08 
 
 
186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578805  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1781  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  81.62 
 
 
190 aa  304  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0627755  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  75.41 
 
 
185 aa  276  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  72.43 
 
 
186 aa  276  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  70.37 
 
 
170 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0468  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  72.5 
 
 
175 aa  228  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1489  acetolactate synthase, small subunit  72.22 
 
 
171 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  64.85 
 
 
184 aa  221  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2721  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.14 
 
 
180 aa  219  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.507095  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2342  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.57 
 
 
180 aa  216  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3353  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.16 
 
 
182 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3010  acetolactate synthase, small subunit  66.88 
 
 
187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0785247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.53 
 
 
180 aa  214  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.95 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852026 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1345  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.16 
 
 
190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00225872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.16 
 
 
190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00968977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5446  acetolactate synthase, small subunit  65.43 
 
 
180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3344  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.21 
 
 
180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1805  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.69 
 
 
190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.673104  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.69 
 
 
190 aa  211  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554097  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.31 
 
 
164 aa  210  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.21 
 
 
180 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2531  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.01 
 
 
190 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.81 
 
 
171 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2801  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.89 
 
 
190 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0238  acetolactate synthase, small subunit  64.81 
 
 
180 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0204828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.74 
 
 
171 aa  208  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2790  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.34 
 
 
190 aa  207  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0627176  normal  0.761903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2100  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.57 
 
 
180 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2262  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.35 
 
 
172 aa  206  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5351  acetolactate synthase, small subunit  62.96 
 
 
180 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.31 
 
 
190 aa  199  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4866  acetolactate synthase, small subunit  62.96 
 
 
180 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5406  acetolactate synthase, small subunit  62.35 
 
 
180 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111863  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.12 
 
 
172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  61.73 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.06 
 
 
163 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.53 
 
 
163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.53 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.16 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  53.8 
 
 
167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
165 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.27 
 
 
163 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.63 
 
 
163 aa  157  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.47 
 
 
163 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  50.96 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 
187 aa  143  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.43 
 
 
168 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.06 
 
 
162 aa  142  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  46.84 
 
 
163 aa  141  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 
170 aa  141  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  48.72 
 
 
159 aa  141  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  46.84 
 
 
161 aa  141  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  48.73 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  48.73 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  47.8 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
172 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 
175 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
161 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  48.73 
 
 
185 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
161 aa  136  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  44.3 
 
 
170 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  43.04 
 
 
165 aa  136  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  47.47 
 
 
166 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  47.47 
 
 
166 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.84 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  44.1 
 
 
167 aa  135  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1202  acetolactate synthase, small subunit  45 
 
 
183 aa  134  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
167 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
167 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3481  acetolactate synthase, small subunit  46.5 
 
 
156 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.171656  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  45.28 
 
 
164 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  45.57 
 
 
163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  45.22 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.84 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
176 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
176 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
165 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  43.67 
 
 
169 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.38 
 
 
174 aa  131  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  130  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.3 
 
 
172 aa  130  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.31 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.31 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  43.04 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  43.04 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1691  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.12 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.91 
 
 
162 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>