More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1661 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
162 aa  319  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0154  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  75.93 
 
 
163 aa  249  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2167  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  77.02 
 
 
163 aa  249  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.998104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  74.07 
 
 
162 aa  247  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1691  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  73.91 
 
 
162 aa  243  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  74.19 
 
 
163 aa  234  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.01 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.12 
 
 
163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.12 
 
 
163 aa  194  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.49 
 
 
163 aa  193  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.49 
 
 
163 aa  193  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
163 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.59 
 
 
168 aa  183  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.72 
 
 
163 aa  181  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  57.42 
 
 
166 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  54.72 
 
 
166 aa  180  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  55.77 
 
 
164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.13 
 
 
161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  53.85 
 
 
166 aa  177  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  53.85 
 
 
166 aa  177  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
165 aa  177  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  55.13 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
167 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
167 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  51.92 
 
 
165 aa  175  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.13 
 
 
172 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  56.41 
 
 
167 aa  174  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.09 
 
 
172 aa  172  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.56 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  54.72 
 
 
165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.78 
 
 
176 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  52.2 
 
 
161 aa  171  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.49 
 
 
172 aa  170  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3481  acetolactate synthase, small subunit  52.56 
 
 
156 aa  169  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.171656  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.56 
 
 
161 aa  170  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.21 
 
 
172 aa  169  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.21 
 
 
175 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  54.19 
 
 
169 aa  167  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.56 
 
 
182 aa  167  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.78 
 
 
176 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  51.28 
 
 
172 aa  167  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.78 
 
 
176 aa  167  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  53.55 
 
 
170 aa  167  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.85 
 
 
170 aa  167  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.64 
 
 
172 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.64 
 
 
172 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
174 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
174 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
174 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.28788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  51.25 
 
 
172 aa  165  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  51.25 
 
 
172 aa  165  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  53.85 
 
 
159 aa  164  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  55.06 
 
 
167 aa  164  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.9 
 
 
168 aa  163  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13211  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.87 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.463823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.87 
 
 
176 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.9 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.9 
 
 
174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  52.26 
 
 
162 aa  161  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  50.32 
 
 
170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  51.92 
 
 
187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  51.9 
 
 
161 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  48.72 
 
 
163 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.28 
 
 
163 aa  160  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1043  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.61 
 
 
184 aa  159  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.678602  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  49.36 
 
 
166 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  50.97 
 
 
207 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  49.68 
 
 
174 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
167 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  51.61 
 
 
160 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.36 
 
 
163 aa  158  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  50.32 
 
 
174 aa  157  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  46.15 
 
 
163 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.3 
 
 
168 aa  157  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
163 aa  156  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1202  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 
183 aa  156  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  47.83 
 
 
168 aa  156  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 
163 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
163 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1591  acetolactate synthase, small subunit  49.06 
 
 
166 aa  155  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  46.25 
 
 
161 aa  155  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01980  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
161 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000298092  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
163 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
163 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
159 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.79 
 
 
163 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3323  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3229  acetolactate synthase, small subunit  49.35 
 
 
167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
163 aa  154  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 
163 aa  154  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.72 
 
 
163 aa  153  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1746  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.44 
 
 
163 aa  152  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.44 
 
 
163 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  47.77 
 
 
164 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
163 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  48.39 
 
 
174 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  48.72 
 
 
163 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>