More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1893 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2170  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  77.6 
 
 
186 aa  285  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578805  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1781  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  74.73 
 
 
190 aa  280  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0627755  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2636  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  75.41 
 
 
186 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1293  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  75.41 
 
 
186 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  72.13 
 
 
186 aa  278  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1172  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  75.41 
 
 
186 aa  276  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.920146  normal  0.661058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0468  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  73.12 
 
 
175 aa  229  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.12 
 
 
180 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852026 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2721  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.95 
 
 
180 aa  219  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.507095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.7 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3344  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.79 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2100  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.79 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  66.88 
 
 
170 aa  218  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2342  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.37 
 
 
180 aa  218  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1489  acetolactate synthase, small subunit  65.66 
 
 
171 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  65.62 
 
 
184 aa  218  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.79 
 
 
180 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3010  acetolactate synthase, small subunit  66.25 
 
 
187 aa  214  8e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0785247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.38 
 
 
164 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.95 
 
 
190 aa  210  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554097  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3353  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.01 
 
 
182 aa  208  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.1 
 
 
171 aa  208  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.64 
 
 
171 aa  207  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2790  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.33 
 
 
190 aa  203  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0627176  normal  0.761903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2531  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.22 
 
 
190 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5446  acetolactate synthase, small subunit  61.25 
 
 
180 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0238  acetolactate synthase, small subunit  61.15 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0204828 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2262  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.38 
 
 
172 aa  199  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2801  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.54 
 
 
190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1805  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.46 
 
 
190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.673104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.22 
 
 
190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00968977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1345  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.22 
 
 
190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00225872  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.64 
 
 
190 aa  193  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5406  acetolactate synthase, small subunit  57.41 
 
 
180 aa  191  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111863  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4866  acetolactate synthase, small subunit  58.13 
 
 
180 aa  191  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5351  acetolactate synthase, small subunit  58.13 
 
 
180 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.62 
 
 
172 aa  190  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  58.13 
 
 
180 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.78 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.14 
 
 
163 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.14 
 
 
163 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.14 
 
 
163 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  56.05 
 
 
167 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.16 
 
 
165 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.87 
 
 
163 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.23 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
168 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
159 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 
163 aa  148  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
170 aa  147  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  51.28 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  47.47 
 
 
166 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  47.47 
 
 
166 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  47.62 
 
 
187 aa  140  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  140  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  47.13 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  47.13 
 
 
161 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 
163 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  47.77 
 
 
172 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  47.77 
 
 
172 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  47.47 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 
163 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.73 
 
 
162 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
163 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 
163 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 
172 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 
163 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  47.2 
 
 
161 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 
163 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 
163 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.5 
 
 
163 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 
163 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  49.04 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.22 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.86 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.22 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.25 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.343992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 
163 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  46.5 
 
 
163 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>