More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4866 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_5351  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
180 aa  360  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4866  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
180 aa  360  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5406  acetolactate synthase, small subunit  97.78 
 
 
180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111863  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5446  acetolactate synthase, small subunit  88.33 
 
 
180 aa  332  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  87.78 
 
 
180 aa  330  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0238  acetolactate synthase, small subunit  86.67 
 
 
180 aa  323  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0204828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.17 
 
 
180 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2100  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.04 
 
 
180 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.17 
 
 
180 aa  228  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3344  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.55 
 
 
180 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.3 
 
 
180 aa  224  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2721  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.55 
 
 
180 aa  225  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.507095  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  64.71 
 
 
184 aa  222  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2342  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.8 
 
 
180 aa  221  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  65.06 
 
 
170 aa  221  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1489  acetolactate synthase, small subunit  63.43 
 
 
171 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.46 
 
 
171 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3010  acetolactate synthase, small subunit  61.82 
 
 
187 aa  216  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0785247 
 
 
-
 
NC_004310  BR1388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.64 
 
 
190 aa  214  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00968977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1345  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.64 
 
 
190 aa  214  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00225872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2531  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.36 
 
 
190 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2801  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.36 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.79 
 
 
190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554097  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2790  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.23 
 
 
190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0627176  normal  0.761903 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1805  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.57 
 
 
190 aa  211  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.673104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.35 
 
 
190 aa  207  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1781  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.46 
 
 
190 aa  204  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0627755  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0468  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.25 
 
 
175 aa  202  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.04 
 
 
186 aa  202  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.17 
 
 
172 aa  200  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1172  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.96 
 
 
186 aa  200  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.920146  normal  0.661058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.46 
 
 
164 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2636  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.5 
 
 
186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1293  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.5 
 
 
186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.58 
 
 
171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2262  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.28 
 
 
172 aa  194  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2170  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.95 
 
 
186 aa  194  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578805  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.13 
 
 
185 aa  191  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3353  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.7 
 
 
182 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.77 
 
 
163 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 
163 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  50.62 
 
 
167 aa  150  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 
163 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
163 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
163 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
163 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
163 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
163 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 
163 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
163 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  47.53 
 
 
163 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.88 
 
 
163 aa  148  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.53 
 
 
163 aa  148  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.88 
 
 
163 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
163 aa  147  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.73 
 
 
163 aa  148  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
163 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1746  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
163 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
163 aa  147  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.77 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.77 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.15 
 
 
163 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.1 
 
 
163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.73 
 
 
163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.85 
 
 
165 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3323  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.77 
 
 
163 aa  144  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  45.91 
 
 
166 aa  143  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
165 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0883  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.44 
 
 
163 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0737902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.25 
 
 
163 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.62 
 
 
163 aa  141  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  45.06 
 
 
163 aa  140  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  45.06 
 
 
161 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.94 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.343992  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.62 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  46.63 
 
 
164 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.88 
 
 
162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0154  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.58 
 
 
163 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.06 
 
 
168 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  45.68 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.94 
 
 
164 aa  137  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.98 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.21 
 
 
163 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1320  acetolactate synthase, small subunit  42.59 
 
 
163 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>