More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2243 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 		 180 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3344  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  96.11 
 
 		 180 aa  354  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2100  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  93.33 
 
 		 180 aa  345  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  90 
 
 		 180 aa  327  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  86.11 
 
 		 180 aa  325  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2342  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  82.22 
 
 		 180 aa  314  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2721  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  81.67 
 
 		 180 aa  312  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.507095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.65 
 
 		 190 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.11 
 
 		 190 aa  248  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1489  acetolactate synthase, small subunit  72.51 
 
 		 171 aa  248  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3010  acetolactate synthase, small subunit  66.48 
 
 		 187 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0785247 
 
 
-
 
NC_004310  BR1388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.19 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00968977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1345  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  65.19 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00225872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  64.97 
 
 		 184 aa  240  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2531  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.32 
 
 		 190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1805  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.09 
 
 		 190 aa  237  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.673104  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2790  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.78 
 
 		 190 aa  235  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0627176  normal  0.761903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2801  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.7 
 
 		 190 aa  235  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5446  acetolactate synthase, small subunit  68.94 
 
 		 180 aa  228  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1781  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.47 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0627755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  66.87 
 
 		 170 aa  227  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0238  acetolactate synthase, small subunit  66.67 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0204828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4866  acetolactate synthase, small subunit  67.3 
 
 		 180 aa  224  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5351  acetolactate synthase, small subunit  67.3 
 
 		 180 aa  224  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5406  acetolactate synthase, small subunit  67.92 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  63.86 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.82 
 
 		 171 aa  222  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0468  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.46 
 
 		 175 aa  221  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.59 
 
 		 164 aa  220  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2170  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.58 
 
 		 186 aa  217  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.79 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.05 
 
 		 186 aa  215  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2636  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.71 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1293  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.71 
 
 		 186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1172  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.21 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.920146  normal  0.661058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3353  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.87 
 
 		 182 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.28 
 
 		 171 aa  200  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.23 
 
 		 172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2262  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.07 
 
 		 172 aa  184  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.66 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.93 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.7 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 		 163 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.07 
 
 		 163 aa  160  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.59 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.59 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.59 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.59 
 
 		 163 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 		 163 aa  157  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.59 
 
 		 163 aa  157  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 		 163 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  49.68 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  49.68 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2104  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.77 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  53.09 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  154  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1746  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 		 163 aa  154  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.58 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.13 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.83 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.04 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.41 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3323  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.68 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1908  acetolactate synthase small subunit  49.37 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00435991  hitchhiker  0.0000119915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  48.45 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  48.73 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  47.17 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  47.17 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.8 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  42.77 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0883  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.45 
 
 		 163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0737902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.95 
 
 		 163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2144  acetolactate synthase, small subunit  46.84 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0207979  normal  0.0119261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  45.51 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  44.1 
 
 		 163 aa  141  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>