More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2801 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2801  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2531  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  92.63 
 
 
190 aa  362  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2790  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  92.11 
 
 
190 aa  357  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0627176  normal  0.761903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  82.63 
 
 
190 aa  321  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554097  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  78.95 
 
 
190 aa  306  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00968977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1345  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  78.95 
 
 
190 aa  306  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00225872  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1805  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  77.37 
 
 
190 aa  302  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.673104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  76.32 
 
 
190 aa  301  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.86 
 
 
180 aa  240  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  63.16 
 
 
184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3344  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.7 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2100  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.16 
 
 
180 aa  237  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.7 
 
 
180 aa  235  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.24 
 
 
180 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1489  acetolactate synthase, small subunit  66.48 
 
 
171 aa  229  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2342  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.62 
 
 
180 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2721  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.16 
 
 
180 aa  229  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.507095  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3010  acetolactate synthase, small subunit  58.97 
 
 
187 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0785247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  62.94 
 
 
170 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5446  acetolactate synthase, small subunit  62.36 
 
 
180 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.01 
 
 
186 aa  216  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  63.07 
 
 
180 aa  215  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2170  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.11 
 
 
186 aa  214  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578805  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4866  acetolactate synthase, small subunit  61.36 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5351  acetolactate synthase, small subunit  61.36 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0238  acetolactate synthase, small subunit  60.11 
 
 
180 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0204828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1781  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.86 
 
 
190 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0627755  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1293  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.89 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2636  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.89 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5406  acetolactate synthase, small subunit  60.8 
 
 
180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111863  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1172  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.89 
 
 
186 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.920146  normal  0.661058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0468  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.34 
 
 
175 aa  207  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.54 
 
 
164 aa  204  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3353  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.3 
 
 
182 aa  199  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.54 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.31 
 
 
171 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.59 
 
 
171 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.6 
 
 
172 aa  190  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2262  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.33 
 
 
172 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.5 
 
 
163 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.1 
 
 
163 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.5 
 
 
163 aa  157  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.1 
 
 
163 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.9 
 
 
163 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.1 
 
 
163 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.6 
 
 
165 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  51.19 
 
 
167 aa  153  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.11 
 
 
168 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.67 
 
 
162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  45.4 
 
 
166 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.51 
 
 
163 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
161 aa  141  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.67 
 
 
162 aa  141  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.71 
 
 
165 aa  140  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  46.3 
 
 
159 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.27 
 
 
163 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.27 
 
 
163 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.67 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1908  acetolactate synthase small subunit  48.8 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00435991  hitchhiker  0.0000119915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.27 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  44.91 
 
 
166 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  44.91 
 
 
166 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  44.44 
 
 
187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.27 
 
 
163 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.45 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.24 
 
 
163 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.18 
 
 
163 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1691  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.27 
 
 
162 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.18 
 
 
163 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  44.31 
 
 
163 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  44.05 
 
 
163 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0154  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.06 
 
 
163 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  42.07 
 
 
163 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  44.05 
 
 
161 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0883  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.4 
 
 
163 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0737902  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.03 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1591  acetolactate synthase, small subunit  43.83 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.85 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  46.11 
 
 
161 aa  135  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.03 
 
 
163 aa  135  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>