More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1471 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
172 aa  340  5.999999999999999e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2262  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  72.51 
 
 
172 aa  249  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  68.6 
 
 
171 aa  245  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  65.87 
 
 
170 aa  222  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1489  acetolactate synthase, small subunit  61.63 
 
 
171 aa  210  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1781  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.25 
 
 
190 aa  208  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0627755  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  58.54 
 
 
184 aa  207  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2721  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.17 
 
 
180 aa  208  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.507095  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3010  acetolactate synthase, small subunit  61.59 
 
 
187 aa  206  9e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0785247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0468  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.92 
 
 
175 aa  206  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5446  acetolactate synthase, small subunit  59.41 
 
 
180 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0238  acetolactate synthase, small subunit  58.82 
 
 
180 aa  205  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0204828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.99 
 
 
180 aa  204  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2342  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.76 
 
 
180 aa  203  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.98 
 
 
186 aa  202  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4866  acetolactate synthase, small subunit  59.17 
 
 
180 aa  200  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5351  acetolactate synthase, small subunit  59.17 
 
 
180 aa  200  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.32 
 
 
190 aa  200  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554097  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3344  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.23 
 
 
180 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2100  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.23 
 
 
180 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1172  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.12 
 
 
186 aa  198  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.920146  normal  0.661058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.23 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5406  acetolactate synthase, small subunit  59.17 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111863  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.93 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.75 
 
 
190 aa  197  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2636  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.88 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1293  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.88 
 
 
186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.9 
 
 
190 aa  195  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00968977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1345  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.9 
 
 
190 aa  195  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00225872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  57.65 
 
 
180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1805  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.9 
 
 
190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.673104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.54 
 
 
164 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2531  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.9 
 
 
190 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.62 
 
 
185 aa  190  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2801  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.6 
 
 
190 aa  190  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2790  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.17 
 
 
190 aa  190  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0627176  normal  0.761903 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.4 
 
 
171 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2170  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.62 
 
 
186 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578805  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3353  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.49 
 
 
182 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  55.21 
 
 
167 aa  171  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  47.24 
 
 
163 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.08 
 
 
163 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.47 
 
 
163 aa  154  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  47.24 
 
 
163 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.24 
 
 
163 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.24 
 
 
163 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.24 
 
 
163 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.24 
 
 
163 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.92 
 
 
163 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.24 
 
 
163 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.24 
 
 
163 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.24 
 
 
163 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.24 
 
 
163 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.17 
 
 
164 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  46.63 
 
 
163 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.24 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.57 
 
 
163 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  44.79 
 
 
166 aa  150  8e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  45.12 
 
 
164 aa  150  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.47 
 
 
163 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.01 
 
 
163 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.01 
 
 
163 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.01 
 
 
163 aa  148  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.17 
 
 
164 aa  148  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.85 
 
 
165 aa  147  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  147  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 
163 aa  147  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  44.79 
 
 
161 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  44.79 
 
 
163 aa  147  9e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.4 
 
 
163 aa  147  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  45.62 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  46.34 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00557  acetolactate synthase III, small subunit  46.06 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.4 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62150  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.79 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0299879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.79 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780093  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4679  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.79 
 
 
163 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.63 
 
 
163 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4677  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.79 
 
 
163 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  hitchhiker  0.00000000335837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0755  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.79 
 
 
163 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100684  hitchhiker  0.000000273125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.79 
 
 
163 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0246688  hitchhiker  0.000231458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0883  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.17 
 
 
163 aa  145  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0737902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.17 
 
 
163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  hitchhiker  0.00000000512539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.01 
 
 
163 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0982  acetolactate synthase, small subunit  44.17 
 
 
163 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.17 
 
 
163 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.01 
 
 
163 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.4 
 
 
163 aa  144  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.01 
 
 
163 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>