More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2262 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2262  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
172 aa  342  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  72.51 
 
 
172 aa  249  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.06 
 
 
171 aa  241  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.58 
 
 
186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  60.84 
 
 
170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  62.96 
 
 
184 aa  210  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2636  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.89 
 
 
186 aa  207  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1293  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.89 
 
 
186 aa  207  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1172  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.35 
 
 
186 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.920146  normal  0.661058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3010  acetolactate synthase, small subunit  61.73 
 
 
187 aa  204  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0785247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1781  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.49 
 
 
190 aa  202  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0627755  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.94 
 
 
164 aa  200  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1489  acetolactate synthase, small subunit  58.24 
 
 
171 aa  200  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0468  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.24 
 
 
175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.38 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5446  acetolactate synthase, small subunit  58.9 
 
 
180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0238  acetolactate synthase, small subunit  59.75 
 
 
180 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0204828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2170  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.75 
 
 
186 aa  195  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578805  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.69 
 
 
171 aa  194  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5351  acetolactate synthase, small subunit  58.28 
 
 
180 aa  194  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4866  acetolactate synthase, small subunit  58.28 
 
 
180 aa  194  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.47 
 
 
190 aa  193  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00968977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1345  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.47 
 
 
190 aa  193  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00225872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  58.28 
 
 
180 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5406  acetolactate synthase, small subunit  58.28 
 
 
180 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111863  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2721  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.21 
 
 
180 aa  191  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.507095  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1805  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.2 
 
 
190 aa  191  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.673104  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.32 
 
 
190 aa  191  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.06 
 
 
180 aa  190  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2342  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.99 
 
 
180 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2531  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.93 
 
 
190 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2100  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.07 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2790  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.49 
 
 
190 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0627176  normal  0.761903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.21 
 
 
190 aa  187  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2801  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.33 
 
 
190 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3344  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.48 
 
 
180 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.07 
 
 
180 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.35 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3353  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.89 
 
 
182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  53.8 
 
 
167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.8 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.31 
 
 
163 aa  157  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.31 
 
 
163 aa  157  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.69 
 
 
163 aa  154  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  48.45 
 
 
166 aa  154  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.37 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.54 
 
 
163 aa  151  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  46.84 
 
 
163 aa  147  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  45.96 
 
 
163 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  47.17 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.06 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  45.96 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  45.57 
 
 
163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.06 
 
 
163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.84 
 
 
163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  45.68 
 
 
164 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.17 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.96 
 
 
168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  143  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  143  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  143  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.73 
 
 
165 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  47.47 
 
 
187 aa  142  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  44.94 
 
 
166 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.2 
 
 
163 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00557  acetolactate synthase III, small subunit  44.17 
 
 
165 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  43.48 
 
 
163 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.43 
 
 
164 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.83 
 
 
164 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  141  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1972  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.59 
 
 
164 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0607984  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
163 aa  141  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2491  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.59 
 
 
164 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126247  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2375  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.59 
 
 
164 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0991612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2387  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.59 
 
 
164 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.57 
 
 
163 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.21 
 
 
164 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1829  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.21 
 
 
164 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2270  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.21 
 
 
164 aa  140  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493078  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.65 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0635  acetolactate synthase, small subunit  44.94 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2278  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.21 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.84 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3604  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.28 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>