More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3353 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3353  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1172  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.16 
 
 
186 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.920146  normal  0.661058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.67 
 
 
180 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2342  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.99 
 
 
180 aa  215  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2636  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.01 
 
 
186 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1293  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.01 
 
 
186 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1781  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.79 
 
 
190 aa  215  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0627755  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2170  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.37 
 
 
186 aa  214  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578805  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2721  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.55 
 
 
180 aa  214  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.507095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6085  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.55 
 
 
180 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3344  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.43 
 
 
180 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2100  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.87 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.337452  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2007  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.99 
 
 
190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554097  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  63.74 
 
 
170 aa  211  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.87 
 
 
180 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1893  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.01 
 
 
185 aa  208  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0874  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.47 
 
 
186 aa  207  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271515  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2790  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.45 
 
 
190 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0627176  normal  0.761903 
 
 
-
 
NC_004310  BR1388  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.38 
 
 
190 aa  204  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00968977  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1345  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.38 
 
 
190 aa  204  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00225872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2531  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.84 
 
 
190 aa  204  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1805  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.91 
 
 
190 aa  203  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.673104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1489  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.61 
 
 
190 aa  202  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2801  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.3 
 
 
190 aa  199  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193996  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  56.07 
 
 
184 aa  200  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3010  acetolactate synthase, small subunit  57.06 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0785247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1489  acetolactate synthase, small subunit  56.73 
 
 
171 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.68 
 
 
171 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5446  acetolactate synthase, small subunit  58.13 
 
 
180 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0238  acetolactate synthase, small subunit  57.5 
 
 
180 aa  188  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0204828 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0468  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.18 
 
 
175 aa  185  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.22 
 
 
171 aa  184  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  56.33 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.23 
 
 
164 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5406  acetolactate synthase, small subunit  55.7 
 
 
180 aa  179  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111863  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4866  acetolactate synthase, small subunit  55.7 
 
 
180 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5351  acetolactate synthase, small subunit  55.7 
 
 
180 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2262  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.89 
 
 
172 aa  178  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.49 
 
 
172 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.5 
 
 
163 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.5 
 
 
163 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.15 
 
 
165 aa  157  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.12 
 
 
163 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.25 
 
 
163 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  49.38 
 
 
163 aa  150  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  50 
 
 
164 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.17 
 
 
168 aa  147  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  50.94 
 
 
167 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  45.28 
 
 
161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  45.28 
 
 
163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  48.05 
 
 
166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  48.43 
 
 
166 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  48.43 
 
 
166 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.84 
 
 
170 aa  140  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.39 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  45.16 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  48.08 
 
 
167 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  44.65 
 
 
163 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
165 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  44.59 
 
 
165 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  47.74 
 
 
163 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  47.44 
 
 
185 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
163 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
163 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.74 
 
 
163 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.94 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.45 
 
 
163 aa  134  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
163 aa  134  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4448  acetolactate synthase, small subunit  44.87 
 
 
173 aa  134  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  43.75 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
163 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  45.81 
 
 
159 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1908  acetolactate synthase small subunit  47.74 
 
 
169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00435991  hitchhiker  0.0000119915 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  45.28 
 
 
166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  46.2 
 
 
161 aa  132  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
163 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.16 
 
 
163 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.16 
 
 
163 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  47.1 
 
 
163 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2931  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.15 
 
 
164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.81 
 
 
163 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.52 
 
 
163 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3400  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.15 
 
 
164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3530  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.15 
 
 
164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.44 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>