More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1261 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
163 aa  319  9.000000000000001e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  93.25 
 
 
163 aa  303  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  89.57 
 
 
163 aa  294  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  82.21 
 
 
163 aa  278  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  79.75 
 
 
163 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  79.75 
 
 
163 aa  269  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  77.91 
 
 
163 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  72.22 
 
 
168 aa  246  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  73.29 
 
 
165 aa  246  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  64.38 
 
 
161 aa  208  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0154  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.52 
 
 
163 aa  200  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1691  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.52 
 
 
162 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  63.52 
 
 
161 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2167  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.89 
 
 
163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.998104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  59.88 
 
 
167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  59.26 
 
 
163 aa  196  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  58.64 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  62.03 
 
 
163 aa  195  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.12 
 
 
162 aa  194  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.64 
 
 
163 aa  193  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.38 
 
 
170 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.75 
 
 
162 aa  193  9e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.63 
 
 
165 aa  192  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  59.63 
 
 
170 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  58.49 
 
 
166 aa  192  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  58.39 
 
 
166 aa  190  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  56.52 
 
 
163 aa  190  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  56.52 
 
 
161 aa  190  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  59.51 
 
 
164 aa  190  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.06 
 
 
164 aa  188  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.01 
 
 
172 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.67 
 
 
164 aa  188  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  56.79 
 
 
170 aa  187  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  57.86 
 
 
172 aa  187  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  57.86 
 
 
172 aa  187  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2021  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  57.14 
 
 
164 aa  187  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  186  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  186  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1329  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
163 aa  186  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  56.79 
 
 
169 aa  186  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3230  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88024  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.66 
 
 
163 aa  186  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.12 
 
 
168 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  60.25 
 
 
167 aa  186  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  56.25 
 
 
166 aa  186  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  56.44 
 
 
164 aa  185  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2227  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.469114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  56.17 
 
 
163 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2076  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  184  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2983  acetolactate synthase, small subunit  56.96 
 
 
166 aa  185  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00470165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3025  acetolactate synthase, small subunit  56.96 
 
 
166 aa  185  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.897404  normal  0.20881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.56 
 
 
163 aa  184  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.17 
 
 
163 aa  184  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.17 
 
 
163 aa  184  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.17 
 
 
163 aa  184  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3481  acetolactate synthase, small subunit  57.69 
 
 
156 aa  184  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.171656  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  183  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0129853  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  59.49 
 
 
161 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.94 
 
 
163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.17 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.94 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.94 
 
 
163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.94 
 
 
163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  53.37 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1746  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.17 
 
 
163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.37 
 
 
174 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3323  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.56 
 
 
163 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2892  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  179  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.018126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  53.12 
 
 
207 aa  179  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1320  acetolactate synthase, small subunit  55.9 
 
 
163 aa  179  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1718  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.59 
 
 
159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  51.85 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  51.25 
 
 
174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.5 
 
 
174 aa  177  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  57.5 
 
 
167 aa  177  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  53.12 
 
 
174 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1903  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.32 
 
 
159 aa  177  8e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.88 
 
 
168 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  49.38 
 
 
170 aa  175  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  51.88 
 
 
174 aa  175  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1336  acetolactate synthase, small subunit  53.12 
 
 
170 aa  175  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275336  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0635  acetolactate synthase, small subunit  51.23 
 
 
163 aa  175  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.8 
 
 
163 aa  175  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0852  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 
159 aa  175  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.889079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0740  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.59 
 
 
159 aa  174  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>