More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3436 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  100 
 
 
169 aa  330  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  81.07 
 
 
170 aa  278  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  73.81 
 
 
170 aa  246  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  66.25 
 
 
161 aa  220  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.09 
 
 
172 aa  213  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  59.76 
 
 
165 aa  210  9e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  63.64 
 
 
167 aa  209  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.76 
 
 
161 aa  205  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  62.35 
 
 
164 aa  204  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.15 
 
 
168 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  64.33 
 
 
166 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.04 
 
 
170 aa  201  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  61.96 
 
 
167 aa  201  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  58.02 
 
 
174 aa  200  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.43 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.41 
 
 
174 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.25 
 
 
167 aa  197  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3553  acetolactate synthase, small subunit  57.41 
 
 
174 aa  197  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6020  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.54 
 
 
168 aa  197  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.12 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  62.11 
 
 
161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  58.33 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  58.33 
 
 
172 aa  195  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1467  acetolactate synthase, small subunit  55.09 
 
 
170 aa  195  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000490839  normal  0.0250967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  60.62 
 
 
160 aa  193  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  54.49 
 
 
175 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.83 
 
 
167 aa  192  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  55.77 
 
 
185 aa  192  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.06 
 
 
164 aa  190  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  55.62 
 
 
174 aa  189  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.17 
 
 
174 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0751  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.26 
 
 
178 aa  189  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.94 
 
 
174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.25 
 
 
184 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
174 aa  188  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  59.35 
 
 
168 aa  187  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.79 
 
 
163 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  55.35 
 
 
171 aa  185  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  56.88 
 
 
165 aa  184  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.61 
 
 
172 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.61 
 
 
172 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  54.32 
 
 
207 aa  184  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1542  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.83 
 
 
169 aa  184  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.17 
 
 
163 aa  184  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  54.37 
 
 
167 aa  183  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
166 aa  183  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502745  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1336  acetolactate synthase, small subunit  55.56 
 
 
170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.275336  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2863  acetolactate synthase, small subunit  58.39 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.6 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.22 
 
 
172 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.21 
 
 
169 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3229  acetolactate synthase, small subunit  54.04 
 
 
167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.41 
 
 
167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0238  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.6 
 
 
169 aa  180  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1675  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.6 
 
 
169 aa  180  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  57.23 
 
 
168 aa  180  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  55.7 
 
 
161 aa  180  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.48 
 
 
182 aa  180  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1591  acetolactate synthase, small subunit  56.13 
 
 
166 aa  179  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.84 
 
 
172 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1907  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.35 
 
 
172 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1887  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.35 
 
 
172 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00850496  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.35 
 
 
172 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146423  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.32 
 
 
163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01980  acetolactate synthase, small subunit  53.5 
 
 
161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000298092  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.97 
 
 
168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08540  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.12 
 
 
169 aa  178  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.097945  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  54.19 
 
 
172 aa  177  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  55.06 
 
 
161 aa  177  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.5 
 
 
176 aa  177  7e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  55.7 
 
 
162 aa  177  9e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.47 
 
 
163 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.9 
 
 
175 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2483  acetolactate synthase, small subunit  55.19 
 
 
159 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.79 
 
 
171 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  53.8 
 
 
172 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.96 
 
 
176 aa  174  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1164  acetolactate synthase, small subunit  55.56 
 
 
174 aa  174  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686831  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.23 
 
 
176 aa  174  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.85 
 
 
163 aa  174  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.62 
 
 
178 aa  172  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.199975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  52.41 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_736  acetolactate synthase, small subunit  59.62 
 
 
178 aa  172  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118552  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1709  acetolactate synthase, small subunit  56.88 
 
 
175 aa  173  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.19 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.19 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.28788  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.19 
 
 
174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4355  acetolactate synthase small subunit  53.09 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00134295  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  54.19 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3021  acetolactate synthase, small subunit  54.72 
 
 
166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000136695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10690  acetolactate synthase, small subunit  54.94 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.492903 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1043  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50 
 
 
184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.678602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  50.62 
 
 
163 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4448  acetolactate synthase, small subunit  51.28 
 
 
173 aa  170  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2385  acetolactate synthase, small subunit  56.79 
 
 
173 aa  169  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13211  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.19 
 
 
174 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.463823  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0683  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.85 
 
 
169 aa  169  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3481  acetolactate synthase, small subunit  51.61 
 
 
156 aa  168  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.171656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>