More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2924 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2924  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
262 aa  521  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0050  hypothetical protein  30.43 
 
 
848 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.159927  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
1073 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
349 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.67 
 
 
324 aa  82  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.96 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2040  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.12763  normal  0.970209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
1032 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  48.08 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 
553 aa  76.6  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  37.27 
 
 
1157 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
597 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0409  glycosyl transferase family 2  38.28 
 
 
462 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.5 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
321 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
357 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
374 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  37.61 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 
146 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  37.88 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1571  cell wall membrane glycosyltransferase  34.52 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.804132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
609 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
1015 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  41.38 
 
 
785 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  38.4 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
1177 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
1177 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
689 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  36.11 
 
 
102 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 
1038 aa  72.4  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  35.61 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  32.56 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  31.64 
 
 
697 aa  72  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  31.34 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  34.15 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  34.48 
 
 
1168 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.61 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0081  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
605 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0614  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  36 
 
 
529 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  36.67 
 
 
672 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  30.77 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0177  putative glycosyl transferase  32.8 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  36.64 
 
 
573 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.19 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2919  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  37.5 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  29.57 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 
379 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.33 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
1250 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0299  teichoic acid biosynthesis protein X, putative  31.43 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  35.64 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  35.14 
 
 
616 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  37.04 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.5 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>