52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1510 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1510  PRC-barrel  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5343  PRC-barrel  58.96 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.981987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2221  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  34.02 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  38.24 
 
 		 163 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  38.24 
 
 		 163 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  38.24 
 
 		 163 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  36.76 
 
 		 160 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  36.76 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  32.53 
 
 		 271 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  33.33 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  38.6 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  35.44 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  29.29 
 
 		 140 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  29.59 
 
 		 129 aa  45.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  32.93 
 
 		 485 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  38.6 
 
 		 175 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  28.83 
 
 		 129 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  32.58 
 
 		 156 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  25.71 
 
 		 125 aa  45.1  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  32.58 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  25 
 
 		 117 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  35.48 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  32.91 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  34.21 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  31.46 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  32.84 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  30.19 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  32.43 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  30.59 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  31.08 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  31.08 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  29.17 
 
 		 117 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  36.76 
 
 		 166 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  31.25 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  31.08 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  28.92 
 
 		 127 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  35.59 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1138  PRC-barrel domain protein  33.94 
 
 		 137 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000314637  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  36.76 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  35.62 
 
 		 148 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  33.33 
 
 		 183 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  25.96 
 
 		 174 aa  42.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  37.29 
 
 		 155 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  34.85 
 
 		 157 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  32.53 
 
 		 169 aa  41.6  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  30.86 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>