34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5343 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5343  PRC-barrel  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.981987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1510  PRC-barrel  57.83 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2221  hypothetical protein  50.82 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  30.93 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  32.26 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  31.18 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  30.43 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  32.61 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  32.61 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  31.18 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  32.26 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  33.66 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  31.18 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  31.18 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  32.67 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  26.88 
 
 		 485 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  30.43 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  31.18 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  32.43 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  32.43 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  32.43 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  31.18 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  29.41 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  33.33 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  28.71 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  29.35 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  29.47 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  27.84 
 
 		 399 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  32.61 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  29.17 
 
 		 173 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  31.52 
 
 		 154 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4163  hypothetical protein  36.67 
 
 		 86 aa  41.2  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  28.92 
 
 		 132 aa  40.8  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>