141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1247 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  269  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98719  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1313  protein of unknown function DUF523  96.83 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1374  hypothetical protein  90.48 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0678885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2686  hypothetical protein  44.92 
 
 		 177 aa  90.9  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1211  hypothetical protein  59.15 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.610765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1560  protein of unknown function DUF523  62.5 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0307  hypothetical protein  47.41 
 
 		 167 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0950359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5211  hypothetical protein  46.55 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5065  hypothetical protein  42.62 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5245  hypothetical protein  39.02 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5158  hypothetical protein  40.98 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.781298  normal  0.791576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4716  hypothetical protein  39.84 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0264  hypothetical protein  39.68 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0643  hypothetical protein  33.87 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0986  protein of unknown function DUF523  62.71 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00542072  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0316  hypothetical protein  36.61 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2552  hypothetical protein  36.61 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0405  hypothetical protein  62.5 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5390  hypothetical protein  39.32 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0957  hypothetical protein  57.63 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0855  hypothetical protein  40.86 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1497  hypothetical protein  40.86 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1693  hypothetical protein  40.86 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884906  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2408  hypothetical protein  40.86 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0350  hypothetical protein  40.86 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04070  hypothetical protein  60.94 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2115  hypothetical protein  60.94 
 
 		 164 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3627  hypothetical protein  57.38 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0910  hypothetical protein  61.54 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3292  hypothetical protein  55.93 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.487222 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4019  hypothetical protein  57.89 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7251  hypothetical protein  58.49 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0905218  normal  0.187589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0317  hypothetical protein  55.74 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0467  hypothetical protein  55 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4045  hypothetical protein  57.89 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3642  hypothetical protein  55.74 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4138  hypothetical protein  55.74 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1904  protein of unknown function DUF523  50 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0737383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3943  protein of unknown function DUF523  55.74 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3823  hypothetical protein  55.74 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2999  hypothetical protein  43.37 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5367  hypothetical protein  43.37 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6115  protein of unknown function DUF523  57.14 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4233  hypothetical protein  39.32 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4903  hypothetical protein  55.17 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48360  hypothetical protein  55.38 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0035  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1663  hypothetical protein  53.57 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4830  hypothetical protein  53.45 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2531  hypothetical protein  33.59 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0315  hypothetical protein  44.83 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.404218  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0582  protein of unknown function DUF523  36.36 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.651218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0046  hypothetical protein  31.3 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1500  hypothetical protein  51.67 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.100899  normal  0.408779 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2835  protein of unknown function DUF523  28.35 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0667885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1206  purine nucleoside phosphorylase  29.75 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0510  hypothetical protein  49.18 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0995192  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1853  purine nucleoside phosphorylase  43.55 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0524  hypothetical protein  49.18 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0936  protein of unknown function DUF523  43.1 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.146002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2745  hypothetical protein  31.52 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.404026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2045  hypothetical protein  47.37 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2594  protein of unknown function DUF523  49.12 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1981  protein of unknown function DUF523  43.66 
 
 		 354 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1437  hypothetical protein  46.43 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0616  hypothetical protein  46.03 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0977  protein of unknown function DUF523  45.45 
 
 		 396 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2145  hypothetical protein  41.38 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0442744  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0041  hypothetical protein  43.33 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0054  hypothetical protein  43.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0988302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1014  hypothetical protein  43.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000132826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1311  hypothetical protein  44.07 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1845  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1164  hypothetical protein  34.4 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1223  hypothetical protein  54 
 
 		 319 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.53904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2844  hypothetical protein  34.29 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2246  protein of unknown function DUF523  32.71 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0593465  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2925  Protein of unknown function DUF1722  40.66 
 
 		 319 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1036  protein of unknown function DUF523  49.15 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0204215  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0260  hypothetical protein  35.24 
 
 		 326 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1309  hypothetical protein  44.83 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2133  hypothetical protein  27.97 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3113  Protein of unknown function DUF1722  55.77 
 
 		 319 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892265  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1078  purine nucleoside phosphorylase  29.75 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1034  protein of unknown function DUF523  32.93 
 
 		 316 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3313  Protein of unknown function DUF1722  39.47 
 
 		 316 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0741  hypothetical protein  44.26 
 
 		 322 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1133  Protein of unknown function DUF1722  54 
 
 		 317 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079138  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0769  hypothetical protein  44.26 
 
 		 322 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0782  hypothetical protein  42.62 
 
 		 322 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4663  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3029  hypothetical protein  35.35 
 
 		 319 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5042  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3230  Protein of unknown function DUF1722  32.93 
 
 		 316 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4802  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1291  hypothetical protein  29.63 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.14711e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5165  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1171  protein of unknown function DUF523  46.77 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4448  hypothetical protein  39.34 
 
 		 322 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>