204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5158 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5158  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  333  7e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.781298  normal  0.791576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5065  hypothetical protein  95.81 
 
 		 167 aa  318  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5211  hypothetical protein  87.95 
 
 		 167 aa  289  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0307  hypothetical protein  86.23 
 
 		 167 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0950359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5390  hypothetical protein  73.72 
 
 		 161 aa  223  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4233  hypothetical protein  69.18 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0405  hypothetical protein  66.25 
 
 		 164 aa  207  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04070  hypothetical protein  65.62 
 
 		 164 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2115  hypothetical protein  65.62 
 
 		 164 aa  204  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2686  hypothetical protein  61.11 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48360  hypothetical protein  68.24 
 
 		 167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1211  hypothetical protein  54.04 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.610765  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5245  hypothetical protein  52.47 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6115  protein of unknown function DUF523  52.66 
 
 		 186 aa  168  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0957  hypothetical protein  53.42 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0264  hypothetical protein  49.38 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3627  hypothetical protein  54.27 
 
 		 154 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1374  hypothetical protein  56.05 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0678885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3823  hypothetical protein  54.27 
 
 		 157 aa  160  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0317  hypothetical protein  52.44 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4716  hypothetical protein  52.76 
 
 		 174 aa  158  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0643  hypothetical protein  53.5 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1560  protein of unknown function DUF523  60 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1313  protein of unknown function DUF523  56.17 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.369156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3943  protein of unknown function DUF523  51.85 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3642  hypothetical protein  51.22 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0582  protein of unknown function DUF523  52.94 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.651218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3292  hypothetical protein  50.94 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.487222 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4045  hypothetical protein  50.29 
 
 		 164 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0315  hypothetical protein  48.12 
 
 		 159 aa  154  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4903  hypothetical protein  50.62 
 
 		 175 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0467  hypothetical protein  51.97 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0035  hypothetical protein  50.98 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4019  hypothetical protein  49.71 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2999  hypothetical protein  50.31 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5367  hypothetical protein  50.31 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0046  hypothetical protein  50.61 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4138  hypothetical protein  51.57 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0910  hypothetical protein  58.39 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168143  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4830  hypothetical protein  54.11 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1437  hypothetical protein  50.33 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0054  hypothetical protein  49.66 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0988302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2531  hypothetical protein  46.05 
 
 		 168 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0986  protein of unknown function DUF523  52.8 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00542072  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0041  hypothetical protein  48.99 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5071  hypothetical protein  48.03 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1014  hypothetical protein  48.99 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000132826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2745  hypothetical protein  49.32 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.404026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0172  hypothetical protein  48.03 
 
 		 153 aa  140  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2835  protein of unknown function DUF523  43.42 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0667885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5069  hypothetical protein  47.74 
 
 		 153 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1171  protein of unknown function DUF523  48.39 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1500  hypothetical protein  47.37 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.100899  normal  0.408779 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0316  hypothetical protein  48.75 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3542  hypothetical protein  47.71 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1497  hypothetical protein  48.75 
 
 		 227 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1693  hypothetical protein  48.75 
 
 		 227 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.884906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0350  hypothetical protein  48.75 
 
 		 227 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0855  hypothetical protein  48.75 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4752  hypothetical protein  44.74 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2552  hypothetical protein  48.75 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148964  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2408  hypothetical protein  48.75 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4663  hypothetical protein  47.1 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5042  hypothetical protein  46.05 
 
 		 153 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1206  purine nucleoside phosphorylase  46.15 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.152138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4802  hypothetical protein  46.05 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5165  hypothetical protein  46.05 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5075  hypothetical protein  47.74 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4644  hypothetical protein  45.39 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0524  hypothetical protein  47.97 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0510  hypothetical protein  47.97 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0995192  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1164  hypothetical protein  45.89 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1904  protein of unknown function DUF523  46.26 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0737383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03050  hypothetical protein  43.15 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1663  hypothetical protein  45.7 
 
 		 167 aa  127  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0616  hypothetical protein  50.68 
 
 		 157 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2145  hypothetical protein  42.48 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0442744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7251  hypothetical protein  55.78 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0905218  normal  0.187589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1981  protein of unknown function DUF523  47.06 
 
 		 354 aa  124  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1036  protein of unknown function DUF523  46.98 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0204215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2246  protein of unknown function DUF523  42.18 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0593465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0147  hypothetical protein  42.96 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3662  hypothetical protein  47.3 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1309  hypothetical protein  41.29 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1313  protein of unknown function DUF523  48.57 
 
 		 152 aa  117  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.378136  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1853  purine nucleoside phosphorylase  40.91 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2594  protein of unknown function DUF523  38.41 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1845  hypothetical protein  42.36 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2161  protein of unknown function DUF523  39.49 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0109253  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2133  hypothetical protein  42.36 
 
 		 147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1311  hypothetical protein  40.65 
 
 		 147 aa  114  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0936  protein of unknown function DUF523  40 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.146002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1291  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.14711e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2045  hypothetical protein  38.36 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1078  purine nucleoside phosphorylase  39.61 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2123  protein of unknown function DUF523  38.36 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0977  protein of unknown function DUF523  41.33 
 
 		 396 aa  107  9.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0527  protein of unknown function DUF523  42.86 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2924  hypothetical protein  44.29 
 
 		 138 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1580  protein of unknown function DUF523  35.42 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>