More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0595 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0595  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0602  hypothetical protein  37.99 
 
 
198 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.774795  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0295  acetyltransferase  35.6 
 
 
228 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  30.67 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2989  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  34.86 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1486  isoleucine patch superfamily acetyltransferase-like protein  35.03 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2095  hexapaptide repeat-containing transferase  33.58 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0046  hypothetical protein  35.34 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000164559  normal  0.0456795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0055  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  35.14 
 
 
268 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28390  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  31.47 
 
 
244 aa  72  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  32 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0815  hexapaptide repeat-containing transferase  31.43 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1182  acetyltransferase, putative  38.98 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.142998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4039  maltose O-acetyltransferase  36.48 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4264  hypothetical protein  32.09 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2926  hypothetical protein  29.38 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1731  galactoside O-acetyltransferase  28.93 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142359  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1845  putative transferase  33.33 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1864  putative transferase  33.33 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1911  putative transferase  33.33 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13050  transferase  33.06 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0120242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2439  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  32.72 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  34.21 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1408  acetyltransferase  29.5 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0573867  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  37.82 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18690  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  33.79 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0158  acetyltransferase  30.38 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0084  putative sugar acetyltransferase  30.64 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546093  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6061  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  30.6 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0439  putative sugar acetyltransferase  31.84 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.627014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1849  putative acetyltransferase  34.43 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4220  hexapaptide repeat-containing transferase  32.77 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  34.17 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003640  galactoside O-acetyltransferase  29.41 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.693048  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3028  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase  28.1 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  32.86 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560945  normal  0.127404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1961  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  37.82 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11607  hitchhiker  0.0000808015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0450  hexapaptide repeat-containing transferase  34.45 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667735  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.48 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3187  hexapaptide repeat-containing transferase  32.2 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0997  galactoside O-acetyltransferase  31.25 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158856  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0883  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  34.53 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00414991  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7377  acetyltransferase, putative  33.58 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00823618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0592  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  34.03 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0419  hexapaptide repeat-containing transferase  32.89 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000074046  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  37.38 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6269  putative acetyltransferase  29.45 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501907  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03419  O-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11510)  32.81 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1146  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.61 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.85 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  45.24 
 
 
176 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2197  putative sugar acetyltransferase  32.72 
 
 
220 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3264  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  26.88 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1118  putative acetyltransferase  30.07 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0675  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  30 
 
 
267 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3668  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
186 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  30.05 
 
 
545 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  33.93 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  33.61 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  31.45 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  52 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2654  hexapaptide repeat-containing transferase  36.51 
 
 
193 aa  62.4  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.411712  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 
185 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  43.04 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  43.04 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0897  transferase family protein  30.07 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1044  putative acetyltransferase  26.8 
 
 
294 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.07 
 
 
186 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1504  maltose O-acetyltransferase  35.11 
 
 
182 aa  62  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02592  O-acetyltransferase  30.73 
 
 
192 aa  62  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4614  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.71 
 
 
187 aa  62  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4244  hexapaptide repeat-containing transferase  31.71 
 
 
187 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.587532  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0245  hexapaptide repeat-containing transferase  37.23 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1657  hypothetical protein  41.82 
 
 
145 aa  61.6  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3155  maltose O-acetyltransferase  34.15 
 
 
187 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3377  maltose O-acetyltransferase  34.15 
 
 
187 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3402  maltose O-acetyltransferase  34.15 
 
 
187 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00827475  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1769  hexapaptide repeat-containing transferase  34.04 
 
 
187 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.16213  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2208  acetyltransferase  33.58 
 
 
265 aa  61.6  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3571  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  48.15 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  37 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3722  hypothetical protein  34.13 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  53.57 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0251  galactoside O-acetyltransferase  27.71 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0630032  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3451  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  50 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  33.04 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0578  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.54 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.566139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  36.08 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 
550 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6417  hypothetical protein  40 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701218  normal  0.982762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3040  acetyltransferase  32.35 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.964066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  50.88 
 
 
187 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0738  hexapaptide repeat-containing transferase  54 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12843  normal  0.0447634 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6263  maltose O-acetyltransferase  31.67 
 
 
183 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3057  acetyltransferase  31.1 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  51.67 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1624  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.68 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3140  maltose O-acetyltransferase  33.61 
 
 
187 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0964249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  31.01 
 
 
312 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3583  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.99 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>