51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0295 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0295  acetyltransferase  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0602  hypothetical protein  42.72 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.774795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0595  hypothetical protein  35.23 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28390  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  40.85 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6061  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  40.58 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2989  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  46.15 
 
 		 284 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4264  hypothetical protein  36.36 
 
 		 274 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1302  transferase family (hexapeptide motif)  27.21 
 
 		 165 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1864  putative transferase  35.29 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3264  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  36.84 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1911  putative transferase  35.29 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1845  putative transferase  35.29 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.713416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0592  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  29.17 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0439  putative sugar acetyltransferase  40 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.627014  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3028  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase  25.71 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1486  isoleucine patch superfamily acetyltransferase-like protein  26.16 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2095  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0055  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  29.77 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2926  hypothetical protein  36.36 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3040  acetyltransferase  28.38 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.964066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1182  acetyltransferase, putative  26.03 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.142998 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4339  hypothetical protein  25.95 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.257588  normal  0.0431137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13050  transferase  34.38 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0120242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0760  hexapaptide repeat-containing transferase  44.23 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0159145 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4144  hexapaptide repeat-containing transferase  24.74 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2408  transferase hexapeptide repeat containing protein  24.51 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2197  putative sugar acetyltransferase  42.31 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6269  putative acetyltransferase  27.09 
 
 		 213 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  28 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0675  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  32.05 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  46.81 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03419  O-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11510)  33.33 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.156384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2268  hypothetical protein  25.5 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000511074 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1802  acetyltransferase  29.41 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1559  hypothetical protein  23.93 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0111619  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11077  sugar O-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03380)  34.83 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3057  acetyltransferase  32.05 
 
 		 288 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  33.9 
 
 		 196 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_5580  predicted protein  31.75 
 
 		 265 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000587392  normal  0.0596868 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5775  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.08 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2654  hexapaptide repeat-containing transferase  40.38 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.411712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3715  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  26.03 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780244  normal  0.0511861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3285  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  25.95 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  38.98 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2208  acetyltransferase  31.58 
 
 		 265 aa  42  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0897  transferase family protein  33.33 
 
 		 183 aa  42  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  39.62 
 
 		 206 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1118  putative acetyltransferase  31.34 
 
 		 183 aa  42  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  26.62 
 
 		 194 aa  42  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  40.38 
 
 		 174 aa  41.6  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6221  putative acetyltransferase protein  40.38 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67697  normal  0.119117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>