44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2160 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2160  coenzyme PQQ synthesis D  100 
 
 		 102 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3420  coenzyme PQQ synthesis D  86.27 
 
 		 102 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0250463  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2032  coenzyme PQQ synthesis D  84.31 
 
 		 102 aa  176  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6303  coenzyme PQQ synthesis protein D  78.22 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0882  coenzyme PQQ synthesis D  76.53 
 
 		 105 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0791  putative pyrroloquinoline quinone synthesis protein D  53.26 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0389  coenzyme PQQ synthesis D  53.26 
 
 		 98 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.886255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2447  coenzyme PQQ synthesis D  53.26 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0183813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3320  coenzyme PQQ synthesis D  48.86 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1150  coenzyme PQQ synthesis D  53.85 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00942325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0080  coenzyme PQQ synthesis D  46.15 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  51.9 
 
 		 361 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1979  coenzyme PQQ synthesis D  46.81 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1800  coenzyme PQQ synthesis D  47.5 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0396916  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5989  coenzyme PQQ synthesis D  49.44 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5767  coenzyme PQQ synthesis D  43.02 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.986527  normal  0.838308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.71 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.71 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0847  coenzyme PQQ synthesis D  43.18 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.675494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  44.05 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0453  coenzyme PQQ synthesis D  43.21 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2360  coenzyme PQQ synthesis D  41.67 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2176  coenzyme PQQ synthesis D  42.17 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1448  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  38.16 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0178012  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3916  coenzyme PQQ synthesis D  42.68 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0690  coenzyme PQQ synthesis D  38.16 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1781  coenzyme PQQ synthesis D  34.94 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2455  coenzyme PQQ synthesis D  42.19 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2834  coenzyme PQQ synthesis D  34.88 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.93819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2491  coenzyme PQQ synthesis D  32.18 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0887783 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01589  bifunctional coenzyme PQQ synthesis protein C/D (Pyrroloquinolinequinone biosynthesis protein C/D)  43.33 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2097  coenzyme PQQ synthesis D  32.18 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4037  coenzyme PQQ synthesis D  29.89 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  34.02 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00486118  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0291  coenzyme PQQ synthesis D  30.49 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2469  pyrroloquinoline quinone synthesis D  31.18 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.516173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  39.74 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3306  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  39.74 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2622  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  30.67 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7190  coenzyme PQQ synthesis D  27.66 
 
 		 93 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0181035  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0247  coenzyme PQQ synthesis D  33.33 
 
 		 98 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00271715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0858  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  29.89 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2587  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein D  34.33 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0672438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0308  putative coenzyme PQQ synthesis protein D  30.49 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0888365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>